RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 GZMMP51124 257 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-212ENST00000492539 CHN2P52757 468 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-212ENST00000492539 C6orf89Q6UWU4 347 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-212ENST00000492539 HACD2Q6Y1H2 254 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-212ENST00000492539 CCDC197Q8NCU1 140 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-212ENST00000492539 HIPK4Q8NE63 616 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-212ENST00000492539 OR10A6Q8NH74 314 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-212ENST00000492539 HPS1Q92902 700 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-212ENST00000492539 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
NELFE-212ENST00000492539 OXGR1Q96P68 337 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-212ENST00000492539 GPR35Q9HC97 309 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-212ENST00000492539 ANGPT4Q9Y264 503 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-212ENST00000492539 SLC43A1O75387 559 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ARR3P36575 388 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 CEACAM16Q2WEN9 425 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ZNF311Q5JNZ3 666 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 LIPNQ5VXI9 398 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ARPINQ7Z6K5 226 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 CALHM3Q86XJ0 350 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 KRT73Q86Y46 540 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 SLC30A8Q8IWU4 369 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ZNF786Q8N393 782 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 SVOPLQ8N434 492 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 RFLNBQ8N5W9 214 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 C1orf159Q96HA4 380 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 C12orf10Q9HB07 376 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 VSTM5A8MXK1 200 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 HAX1O00165 279 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 NUDT2P50583 147 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 HOXC5Q00444 222 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 RIN1Q13671 783 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 GPR137CQ8N3F9 429 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ECSITQ9BQ95 431 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 CRLF2Q9HC73 371 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 AP3M1Q9Y2T2 418 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 M0R082 166 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 OR2T1O43869 369 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 PRKAR1BP31321 381 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 PCGF2P35227 344 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 NPRL3Q12980 569 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 VMACQ2NL98 169 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 FAM69AQ5T7M9 428 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 C5orf46Q6UWT4 87 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 MDP1Q86V88 176 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 CCDC36Q8IYA8 594 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 CDK20Q8IZL9 346 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 TMEM123Q8N131 208 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 LINC01356Q8N9X3 169 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 PIK3C3Q8NEB9 887 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 IL17RDQ8NFM7 739 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ZNF417Q8TAU3 575 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 TAAR8Q969N4 342 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 OR2M2Q96R28 347 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ZNF607Q96SK3 696 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 NOX3Q9HBY0 568 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 USP22Q9UPT9 525 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 FAM220BPB1ANY3 271 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 NDUFAB1O14561 156 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 TCF21O43680 179 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 SERPINB7O75635 380 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 APEX1P27695 318 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 AQP1P29972 269 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 CDH15P55291 814 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 DAG1Q14118 895 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 PHYHD1Q5SRE7 291 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ERICH5Q6P6B1 374 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 LSMEM1Q8N8F7 131 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 UBASH3BQ8TF42 649 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 SLC38A4Q969I6 547 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 ZNF583Q96ND8 569 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 DYNLRB1Q9NP97 96 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 B3GNT2Q9NY97 397 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 TAGLN3Q9UI15 199 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa17.16■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 PRORSD1PA6NEY8 169 aa17.16■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 HTR2AP28223 471 aa17.16■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 GRPRP30550 384 aa17.16■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 C1DQ13901 141 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 KRT72Q14CN4 511 aa17.16■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 TRIP10Q15642 601 aa17.16■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
NELFE-212ENST00000492539 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms