RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 CRLF1O75462 422 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 SERPINI2O75830 405 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 KRT33AO76009 404 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 KRT34O76011 436 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 VAMP5O95183 116 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 PATE4P0C8F1 98 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF43P17038 809 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 IL1RL1Q01638 556 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 KLF10Q13118 480 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 CAMK2DQ13557 499 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 NRF1Q16656 503 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 RABL3Q5HYI8 236 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 AGAP6Q5VW22 663 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 ULK3Q6PHR2 472 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 VHLLQ6RSH7 139 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM123Q8N131 208 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF525Q8N782 197 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC35B4Q969S0 331 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 BOD1Q96IK1 185 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 OR2M2Q96R28 347 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 NANOGQ9H9S0 305 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 C12orf10Q9HB07 376 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 C11orf98E9PRG8 122 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 FXYD1O00168 92 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 PLPP3O14495 311 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 AIM2O14862 343 aa6.34□□□□□ -1.39
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PRPF4B-208ENST00000490653 TMCC2O75069 709 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC43A1O75387 559 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 SERPINB7O75635 380 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 CH25HO95992 272 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 CECR9P0C854 216 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 NAAAQ02083 359 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 TGFBR3Q03167 851 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 PIGFQ07326 219 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 CYP51A1Q16850 503 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 MDP1Q86V88 176 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 KRT73Q86Y46 540 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC58Q96CX6 371 aa6.34□□□□□ -1.39
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PRPF4B-208ENST00000490653 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF75AQ96N20 296 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF607Q96SK3 696 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 CRLF2Q9HC73 371 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 SAR1AQ9NR31 198 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF4B-208ENST00000490653 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ANK2Q01484 3957 aa6.33□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.33□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.33□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.33□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.33□□□□□ -1.4
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.33□□□□□ -1.4
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