RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482272.5

CTDSP1-208, Transcript of CTD small phosphatase 1, human

TSL 2

Gene CTDSP1, Length 984 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDSP1-208	ENST00000482272	THBS4	P35443	961 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	NR4A2	P43354	598 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	MTPN	P58546	118 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	HGFAC	Q04756	655 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	CAMK2D	Q13557	499 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	NFYC	Q13952	458 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	DAG1	Q14118	895 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	GGTLC2	Q14390	218 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	GSG1	Q2KHT4	349 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	SPATA21	Q7Z572	469 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	MDP1	Q86V88	176 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	ARHGDIG	Q99819	225 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTDSP1-208	ENST00000482272	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272		M0R3H8	397 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	SERPINI2	O75830	405 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	SEC14L2	O76054	403 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	LYPD3	O95274	346 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	CRYBA2	P53672	197 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	PIGF	Q07326	219 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	ZNF627	Q7L945	461 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	DOK1	Q99704	481 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	NANS	Q9NR45	359 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272		A0A0G2JND7	137 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	RNF212B	A8MTL3	300 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	C11orf98	E9PRG8	122 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	FBP2	O00757	339 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	RAB36	O95755	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	CH25H	O95992	272 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	HLA-H	P01893	362 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	HIST1H2AB	P04908	130 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	NR4A1	P22736	598 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	CSNK1A1	P48729	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	GZMM	P51124	257 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	BID	P55957	195 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	RAB1A	P62820	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	ZP4	Q12836	540 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	FAM166A	Q6J272	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	SVOPL	Q8N434	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	OR10A6	Q8NH74	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	MPP4	Q96JB8	637 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	FOXB1	Q99853	325 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	SH3GL1	Q99961	368 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	NOX3	Q9HBY0	568 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	NPHS2	Q9NP85	383 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	CMAHP	Q9Y471	501 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	ABCA1	O95477	2261 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	TMEM129	A0AVI4	362 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	RNF13	O43567	381 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	ENTPD5	O75356	428 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	UBL3	O95164	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	STAMBP	O95630	424 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTDSP1-208	ENST00000482272	UMPS	P11172	480 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms