RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474172.1

SETX-204, Transcript of senataxin, humanhuman

TSL 3

Gene SETX, Length 719 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-204ENST00000474172 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 AMELYQ99218 206 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 JAM3Q9BX67 310 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ASPNQ9BXN1 380 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 PRRG3Q9BZD7 231 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 NUAK2Q9H093 628 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 RACGAP1Q9H0H5 632 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SYT4Q9H2B2 425 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ZFP64Q9NPA5 681 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SERINC1Q9NRX5 453 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 KLHL13Q9P2N7 655 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 B9D1Q9UPM9 204 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 LIPGQ9Y5X9 500 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ASPMQ8IZT6 3477 aa9□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 PRSS37A4D1T9 235 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 OR5H15A6NDH6 313 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 NME2P1O60361 137 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 TRAPPC6AO75865 159 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 GLCEO94923 617 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 GABARAPO95166 117 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 WNT11O96014 354 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 PDGFAP04085 211 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 CTLA4P16410 223 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 NME2P22392 152 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ENPP1P22413 925 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 GDF1P27539 372 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 MAGEA5P43359 124 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 RGS6P49758 472 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 GFRA1P56159 465 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 H3F3AP84243 136 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 HSF1Q00613 529 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 TLE3Q04726 772 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 LGALS3BPQ08380 585 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 PUDPQ08623 228 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 GGTLC2Q14390 218 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 INSL4Q14641 139 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 MEP1BQ16820 701 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SLC35D2Q76EJ3 337 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 TIGD4Q8IY51 512 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SCAIQ8N9R8 606 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SYT14Q8NB59 555 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 OR10H4Q8NGA5 316 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 OR14L1PQ8NHC6 308 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 THAP4Q8WY91 577 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 HTRA1Q92743 480 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 RFKQ969G6 155 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 MIB2Q96AX9 1013 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SCMH1Q96GD3 660 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ADGRG7Q96K78 797 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 CENPOQ9BU64 300 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ALG12Q9BV10 488 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 TEX12Q9BXU0 123 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 RERGLQ9H628 205 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 WDR76Q9H967 626 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 FANCFQ9NPI8 374 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 HAO2Q9NYQ3 351 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.99□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 A0A1W2PNV4 684 aa8.98□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 TMEM129A0AVI4 362 aa8.98□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.98□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 VGLL3A8MV65 326 aa8.98□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SULT2B1O00204 365 aa8.98□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 PSMD9O00233 223 aa8.98□□□□□ -0.97
SETX-204ENST00000474172 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms