RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 OR6N1Q8NGY5 312 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS4Y2Q8TD47 263 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 SLITRK2Q9H156 845 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DENND4AQ7Z401 1863 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 LOC100509620A0A075B734 347 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC25A12O75746 678 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFB2O95178 105 aa12.33□□□□□ -0.44
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SH3BP1-206ENST00000469947 OR2L8Q8NGY9 312 aa12.33□□□□□ -0.44
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SH3BP1-206ENST00000469947 CPMP14384 443 aa12.33□□□□□ -0.44
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SH3BP1-206ENST00000469947 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.33□□□□□ -0.44
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SH3BP1-206ENST00000469947 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB11FIP2Q7L804 512 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PRSS41Q7RTY9 318 aa12.33□□□□□ -0.44
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SH3BP1-206ENST00000469947 SLC35F3Q8IY50 421 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 OR1J2Q8NGS2 313 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 OR5AK2Q8NH90 309 aa12.33□□□□□ -0.44
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SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM231Q9H6L2 316 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 STEAP1Q9UHE8 339 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa12.32□□□□□ -0.44
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SH3BP1-206ENST00000469947 XRCC3O43542 346 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
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SH3BP1-206ENST00000469947 OR4E1P0C645 316 aa12.32□□□□□ -0.44
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SH3BP1-206ENST00000469947 PPIAP62937 165 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 GGTLC2Q14390 218 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 LEG1Q6P5S2 330 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 LILRA6Q6PI73 481 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 LMF1Q96S06 567 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
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