RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469297.1

CACNA2D1-208, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, human

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 413 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RAB33B	Q9H082	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ALG9	Q9H6U8	611 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297		H0YL77	283 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	EI24	O14681	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NXPH4	O95158	308 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NDUFA7	O95182	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LY6G6D	O95868	133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	IGSF6	O95976	241 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FOLR1	P15328	257 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PSMA2	P25787	234 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TEAD1	P28347	426 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OTX2	P32243	289 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TPI1	P60174	286 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RHOA	P61586	193 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SLC36A3	Q495N2	470 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NR4A3	Q92570	626 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	VSTM2L	Q96N03	204 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GPA33	Q99795	319 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LIME1	Q9H400	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NT5DC2	Q9H857	520 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297		A0A087X002	238 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SGK494	L7N484	410 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NR5A2	O00482	541 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KLHL41	O60662	606 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SLC19A2	O60779	497 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SCRG1	O75711	98 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MFN2	O95140	757 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	IVL	P07476	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SP1	P08047	785 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RGR	P47804	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	AP1S1	P61966	158 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	BNIP1	Q12981	228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NIPAL3	Q6P499	406 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NPW	Q8N729	165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NUS1	Q96E22	293 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ART5	Q96L15	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LITAF	Q99732	161 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SP140L	Q9H930	580 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297		Q9HAA7	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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