RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466405.1

WDR48-208, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene WDR48, Length 4,925 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-208ENST00000466405 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 TCAPO15273 167 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 SELENOFO60613 162 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 DFFBO76075 338 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 LAP3P28838 519 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 AKT2P31751 481 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 NNATQ16517 81 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 DCST2Q5T1A1 773 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 TOMM40LQ969M1 308 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 CMTM3Q96MX0 182 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 DGAT2Q96PD7 388 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 ALG12Q9BV10 488 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 CMC2Q9NRP2 79 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 CA10Q9NS85 328 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 DEC1Q9P2X7 70 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 MED16Q9Y2X0 877 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 CCL16O15467 120 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 SERPINA2P20848 420 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 GNRHRP30968 328 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 SLC11A1P49279 550 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 ASPGQ86U10 573 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 PFN4Q8NHR9 129 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 PDFQ9HBH1 243 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 GFYI3L273 518 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 DVL2O14641 736 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 ABCD4O14678 606 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 TAAR5O14804 337 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 CTSLP07711 333 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 C1SP09871 688 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 ELOCQ15369 112 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 KIRREL1Q96J84 757 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 MYADMQ96S97 322 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 MSRAQ9UJ68 235 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 MAFFQ9ULX9 164 aa6.05□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 A0A087X0M5 115 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 A0A1B0GX30 115 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 MPTX1A8MV57 137 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 NFATC1O95644 943 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 FGF2P09038 288 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 NPPBP16860 134 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 CASRP41180 1078 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 PRLHRP49683 370 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 CLDN2P57739 230 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 GUCA2BQ16661 112 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 OR2T2Q6IF00 324 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 SULF2Q8IWU5 870 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 SYS1Q8N2H4 156 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 SEC11CQ9BY50 192 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 HHLA2Q9UM44 414 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 FITM1A5D6W6 292 aa6.04□□□□□ -1.44
WDR48-208ENST00000466405 LINC00587B1AMM8 73 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms