RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 FZR1Q9UM11 496 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 NPIPA1Q9UND3 350 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 POFUT2Q9Y2G5 429 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 WIF1Q9Y5W5 379 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 ADGRL2O95490 1459 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 TAF1P21675 1872 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 METP08581 1390 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 NRAPQ86VF7 1730 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A0G2JLW4 131 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A1B0GV72 72 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 A6NIZ1 184 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 EFCAB7A8K855 629 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 A8MUA0 341 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 LEUTXA8MZ59 168 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 CLDN25C9JDP6 229 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 E5RJQ4 531 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 TSTD3H0UI37 97 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 SULT1C2O00338 296 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 P2RX6O15547 441 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 GPAA1O43292 621 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 FADS1O60427 444 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 SCN2BO60939 215 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 FKBP6O75344 327 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 SAP30O75446 220 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 UPK3AO75631 287 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 POP7O75817 140 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 CDK2AP2O75956 126 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 SUPT7LO94864 414 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 H6PDO95479 791 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 LATS1O95835 1130 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 PTTG1O95997 202 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 CRHP06850 196 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 LINC00271P0C7V0 271 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 TRAPPC2P0DI81 140 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 DAOP14920 347 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 CD1EP15812 388 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 NQO2P16083 231 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 TBXA2RP21731 343 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 ZP3P21754 424 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 IL12AP29459 219 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 CSKP41240 450 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 HTR5AP47898 357 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 SGSHP51688 502 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 VLDLRP98155 873 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 BNIP2Q12982 314 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 BIKQ13323 160 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 GRB7Q14451 532 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC1A5Q15758 541 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 GUK1Q16774 197 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 NDUFAF6Q330K2 333 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 SNAI3Q3KNW1 292 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 CDNFQ49AH0 187 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 ACTBL2Q562R1 376 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 MTX3Q5HYI7 312 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 MEDAGQ5VYS4 303 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC25A25Q6KCM7 469 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 NANOGP8Q6NSW7 305 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 LEG1Q6P5S2 330 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM107Q6UX40 140 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 GFRALQ6UXV0 394 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF562Q6V9R5 426 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 RAD9BQ6WBX8 426 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 Q6ZRG5 221 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 CREB3L2Q70SY1 520 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 ANKRD37Q7Z713 158 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 ACOT1Q86TX2 421 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 CATSPER3Q86XQ3 398 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM219Q86XT9 240 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM199Q8N511 208 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC54Q8NEL0 328 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 STXBP6Q8NFX7 210 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 GLYATL2Q8WU03 294 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 GTF2H4Q92759 462 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC38A4Q969I6 547 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM203Q969S6 136 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 UPRTQ96BW1 309 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 L3HYPDHQ96EM0 354 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 PRRC1Q96M27 445 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 MBOAT7Q96N66 472 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 TEAD3Q99594 435 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 COPS8Q99627 209 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-205ENST00000460278 AIF1LQ9BQI0 150 aa3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms