RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 PMPCAQ10713 525 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 IL18R1Q13478 541 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 GINS1Q14691 196 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 MESTQ5EB52 335 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ACSM5Q6NUN0 579 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC35D2Q76EJ3 337 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ADCK1Q86TW2 530 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 UEVLDQ8IX04 471 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 KDM8Q8N371 416 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 OR6X1Q8NH79 312 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC120Q96HB5 630 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 KCNK17Q96T54 332 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 CMC2Q9NRP2 79 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ORC6Q9Y5N6 252 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 FLNCQ14315 2725 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 H3BN98 237 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 DVL2O14641 736 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 SURF4O15260 269 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 RNF13O43567 381 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 AHCYL1O43865 530 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 PGA4P0DJD7 388 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 PGA3P0DJD8 388 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 IFNGR1P15260 489 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 CHRNB4P30926 498 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 OPRM1P35372 400 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 CAPGP40121 348 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 CTXN1P60606 82 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ERVK-25P63136 954 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 RUNX1T1Q06455 604 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF691Q5VV52 312 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 TTC23Q5W5X9 447 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM225Q6GV28 225 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 XKRXQ6PP77 449 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 NAXEQ8NCW5 288 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 TXNDC15Q96J42 360 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 Q96M85 177 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF570Q96NI8 536 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 OR2M2Q96R28 347 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 IFT27Q9BW83 186 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 MED29Q9NX70 200 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 EMC3Q9P0I2 261 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1W2PRG6 482 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 A6NIZ1 184 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 C11orf98E9PRG8 122 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 OR6A2O95222 327 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 IL18BPO95998 194 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 CGAP01215 116 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 HMGN1P05114 100 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 YES1P07947 543 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 GNAO1P09471 354 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF43P17038 809 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 AGAP20933 346 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 AHCYP23526 432 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 EDNRAP25101 427 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 CTSSP25774 331 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL4P36578 427 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 PCYT1AP49585 367 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 RPS6KA3P51812 740 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC25A1P53007 311 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms