RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 PRAMEF11O60813 436 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 MTHFD2P13995 350 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ARSAP15289 507 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 GNRHRP30968 328 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CRYGNQ8WXF5 182 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 FAM210BQ96KR6 192 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ASB16Q96NS5 453 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR51I2Q9H344 312 aa5.99□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 FAM72CH0Y354 149 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 MSTNO14793 375 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 PLGP00747 810 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TBXA2RP21731 343 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TAS2R30P59541 319 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 HBG1P69891 147 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 HBG2P69892 147 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SHC2P98077 582 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 FAM72AQ5TYM5 149 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 FAM72DQ6L9T8 149 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 FAM72BQ86X60 149 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF695Q8IW36 515 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 LAS2Q8IYD9 372 aa5.99□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 CMKLR1Q99788 373 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.99□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 A0A0U1RQK1 487 aa5.99□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 ZNF789Q5FWF6 425 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 PRR27Q6MZM9 219 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 COMMD6Q7Z4G1 85 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR4C15Q8NGM1 316 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR51A7Q8NH64 312 aa5.99□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.456e-7■■■■□ 25.2
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SBNO1-202ENST00000420886 PLA2G10O15496 165 aa5.99□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 A6NLC8 198 aa5.99□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 HSF1Q00613 529 aa5.99□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 OR6K2Q8NGY2 324 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 NOX4Q9NPH5 578 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OSER1Q9NX31 292 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CCSO14618 274 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 HLA-DQB1P01920 261 aa5.99□□□□□ -1.45
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