RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420709.5

PRAME-207, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene PRAME, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-207ENST00000420709 TMEM27Q9HBJ8 222 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 TMBIM4Q9HC24 238 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 TCF7L2Q9NQB0 619 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ZNF224Q9NZL3 707 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 SELENONQ9NZV5 590 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 A0A0B4J2E0 115 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 A0A1B0GX12 115 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 C11orf98E9PRG8 122 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 M0R3H8 397 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 PATE4P0C8F1 98 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 AHCYP23526 432 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 IDH3AP50213 366 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 SEC24CP53992 1094 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 SLC18A1P54219 525 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 CDH12P55289 794 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 CDH15P55291 814 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 PUDPQ08623 228 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ALKBH6Q3KRA9 238 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ELFN2Q5R3F8 820 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 FAM91A1Q658Y4 838 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 CARM1Q86X55 608 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 CCDC36Q8IYA8 594 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 SMYD1Q8NB12 490 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 OR6N1Q8NGY5 312 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ZNF75AQ96N20 296 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 EPYCQ99645 322 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 FOXB1Q99853 325 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 SLC13A4Q9UKG4 626 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 CORINQ9Y5Q5 1042 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ZNF726A6NNF4 738 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 M0R233 179 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 PLPP3O14495 311 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 SYNGR3O43761 229 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 RAB36O95755 333 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 HPXP02790 462 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 OPN1SWP03999 348 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ZNF35P13682 527 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ITGA2P17301 1181 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 SLC6A2P23975 617 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 COL8A2P25067 703 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 GIPRP48546 466 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 CSNK1A1P48729 337 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 BIDP55957 195 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 RAB39AQ14964 217 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 AGKQ53H12 422 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 NHLRC1Q6VVB1 395 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ARMC8Q8IUR7 673 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 SCAIQ8N9R8 606 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 OR6S1Q8NH40 331 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 FGFBP3Q8TAT2 258 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 HPS1Q92902 700 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 LRR1Q96L50 414 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ZNF607Q96SK3 696 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 LPAR2Q9HBW0 351 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 SLC52A3Q9NQ40 469 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 REV1Q9UBZ9 1251 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 NOX1Q9Y5S8 564 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 PRORSD1PA6NEY8 169 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 WNT9BO14905 357 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 TCF21O43680 179 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 C8BP07358 591 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ADORA3P0DMS8 318 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 RAB1AP62820 205 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 GALK2Q01415 458 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 MELKQ14680 651 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 LIPNQ5VXI9 398 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 WDR88Q6ZMY6 472 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 HIPK4Q8NE63 616 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 OR5J2Q8NH18 312 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 YIPF5Q969M3 257 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 MCHR1Q99705 422 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 TMEM43Q9BTV4 400 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 OR51B6Q9H340 312 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 TMEM38AQ9H6F2 299 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ANGPT4Q9Y264 503 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 EVPLLA8MZ36 301 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 FAM157AC9JC47 383 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PRAME-207ENST00000420709 ERLIN1O75477 346 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms