RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGSF6O95976 241 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 UROSP10746 265 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBL4AP11441 157 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP6V1B2P21281 511 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 CXCR2P25025 360 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 AQP2P41181 271 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAD52P43351 418 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCNG1P51959 295 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 AK2P54819 239 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL6IP1Q15041 203 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 POSTNQ15063 836 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZSCAN26Q16670 478 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBED5Q49AG3 693 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM154Q6P9G4 183 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM270Q6UE05 265 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTNL8Q6UX41 500 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 DOLPP1Q86YN1 238 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q8N2B8 174 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 MINDY1Q8N5J2 469 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 SETD6Q8TBK2 473 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC51Q96ER9 411 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 COG3Q96JB2 828 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGLYRP3Q96LB9 341 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2E2Q96LR5 201 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA33Q96N06 139 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 S1PR3Q99500 378 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGPAT1Q99943 283 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 NTMT1Q9BV86 223 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPDPFQ9H3Y8 114 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNJ16Q9NPI9 418 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDRG1Q9NUG6 133 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 QPCTLQ9NXS2 382 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 B3GNT2Q9NY97 397 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANAPC5Q9UJX4 755 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLA2G4CQ9UP65 541 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 STK38LQ9Y2H1 464 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR52Q9Y2T5 361 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMED7Q9Y3B3 224 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC42Q9Y546 428 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRPV2Q9Y5S1 764 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 LHFPL6Q9Y693 200 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 MUC17Q685J3 4493 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYT7O43581 403 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 CACNG3O60359 315 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRAF2O60831 178 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 GSTA2P09210 222 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSF3P09919 207 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPRR2AP35326 72 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCK1P35558 622 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOX6P35712 828 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 MFAP3P55082 362 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 GABPAQ06546 454 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF33AQ06730 810 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCRN3Q0VDG4 424 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTN1A1Q13410 526 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPRCAPQ14761 206 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPHARQ15513 63 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 MED22Q15528 200 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 STXBP2Q15833 593 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC38Q502W7 563 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 PYCR3Q53H96 274 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 YIF1BQ5BJH7 314 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 LIPNQ5VXI9 398 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 NLRP9Q7RTR0 991 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOB3BQ86TA1 216 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 C14orf37Q86TY3 774 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPNE9Q8IYJ1 553 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYO1HQ8N1T3 1032 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPRMLQ8N4K4 120 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR11H7Q8NGC8 314 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5C1Q8NGR4 320 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCOA7Q8NI08 942 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 UCMAQ8WVF2 138 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDN23Q96B33 292 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 RMDN1Q96DB5 314 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 MARVELD1Q9BSK0 173 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOOQ9BUR5 198 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM59Q9BXS4 323 aa-1.94□□□□□ -2.72
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