RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 F13BP05160 661 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 LIMS3P0CW19 117 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 LIMS4P0CW20 117 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 NR2C1P13056 603 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 CD46P15529 392 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 CD36P16671 472 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 CPEP16870 476 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 SPI1P17947 270 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 GALP22466 123 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 CRABP1P29762 137 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 RGS6P49758 472 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 TAS2R43P59537 309 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 FOXO1Q12778 655 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 MYBPHQ13203 477 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 TPBGQ13641 420 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 LY6DQ14210 128 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 MED22Q15528 200 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 OR1C1Q15619 314 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 OR7A5Q15622 319 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL12Q53G59 568 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 LEG1Q6P5S2 330 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 PAQR6Q6TCH4 344 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 MDS2Q8NDY4 140 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 SDR9C7Q8NEX9 313 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 OR2M7Q8NG81 312 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 OTULINQ96BN8 352 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 ARL5BQ96KC2 179 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 OXGR1Q96P68 337 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 GNRHR2Q96P88 292 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 NMNAT3Q96T66 252 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 TSC22D3Q99576 134 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 COQ7Q99807 217 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 MFRPQ9BY79 579 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL1Q9NR64 748 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 PCSK5Q92824 1860 aa8.8□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 DAPL1A0PJW8 107 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 OR2M5A3KFT3 312 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS37A4D1T9 235 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 OR6C68A6NDL8 312 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 AQP7P3A6NL99 342 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 HSPB2A8KAH6 182 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 H3BML4 177 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 H3BMQ9 156 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 MASP2O00187 686 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 SULT2B1O00204 365 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 PHYHO14832 338 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 NME2P1O60361 137 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 WDPCPO95876 746 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 BCL10O95999 233 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 HPNP05981 417 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 SP1P08047 785 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 NME2P22392 152 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 AHCYP23526 432 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 UGT2B10P36537 528 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 ACVR1BP36896 505 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 TGFBR2P37173 567 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 DNASE1L1P49184 302 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 ETV1P50549 477 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 UCNP55089 124 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 OR2B6P58173 313 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 ACTA2P62736 377 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 ACTG2P63267 376 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 TUBA1BP68363 451 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 H3F3AP84243 136 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 HSF1Q00613 529 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 CDC20Q12834 499 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 CLN3Q13286 438 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 POU4F3Q15319 338 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 TGIF1Q15583 401 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 TRAM1Q15629 374 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 HSPB2Q16082 182 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 ACKR1Q16570 336 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 MESTQ5EB52 335 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 PDSS1Q5T2R2 415 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.79□□□□□ -1
POLR1A-202ENST00000409024 RAET1LQ5VY80 246 aa8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms