RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 ZNF700Q9H0M5 742 aa21.39■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 TXNIPQ9H3M7 391 aa21.39■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 R4GN57 208 aa21.39■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 MED12Q93074 2177 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 RPP14O95059 124 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 OPN1LWP04000 364 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 TFPIP10646 304 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 PSKH1P11801 424 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 HSF2Q03933 536 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 IL20RBQ6UXL0 311 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 SYT9Q86SS6 491 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 NXPE2Q96DL1 559 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 LOXL2Q9Y4K0 774 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 SSX4O60224 188 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 MYL9P24844 172 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 PPP3R1P63098 170 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 C19orf57Q0VDD7 668 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 PLPPR5Q32ZL2 321 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 C5orf46Q6UWT4 87 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 CDC20BQ86Y33 519 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 OR11G2Q8NGC1 345 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 OR14A2Q96R54 314 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 TMEM185BQ9H7F4 350 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 CACNA1HO95180 2353 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 TMCC2O75069 709 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 STK17BO94768 372 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 CENPAP49450 140 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 RPS18P62269 152 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 PUDPQ08623 228 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 CNIH2Q6PI25 160 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 SP140LQ9H930 580 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 TBC1D24Q9ULP9 559 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 B4E171 279 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 SLC16A7O60669 478 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 TSPAN7P41732 249 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 ETFDHQ16134 617 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 DCAF12Q5T6F0 453 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 ZNF554Q86TJ5 538 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 ZNF160Q9HCG1 818 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 LAMP5Q9UJQ1 280 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 HLA-DQA2P01906 255 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 IL7P13232 177 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 CTLA4P16410 223 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 FOLR3P41439 243 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 RANBP1P43487 201 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 CCDC58Q4VC31 144 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 POC1BQ8TC44 478 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 INTS14Q96SY0 518 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 SDHAF3Q9NRP4 125 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 MS4A18H0YCH9 400 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 PTTG1O95997 202 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 IMPDH2P12268 514 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 AVPR2P30518 371 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 MS4A18Q3C1V0 323 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 HBMQ6B0K9 141 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 GDPD3Q7L5L3 318 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 WDSUB1Q8N9V3 476 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 MFSD8Q8NHS3 518 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 DDIT4LQ96D03 193 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 B9D1Q9UPM9 204 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 SDK2Q58EX2 2172 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 ZFPL1O95159 310 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 MSX1P28360 303 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 MAGEB1P43366 347 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 DEFA1P59665 94 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 DEFA3P59666 94 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 EXT1Q16394 746 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 LIPNQ5VXI9 398 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 SFXN4Q6P4A7 337 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 WDFY1Q8IWB7 410 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 CADM3Q8N126 398 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 YIPF7Q8N8F6 280 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 THEM6Q8WUY1 208 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 ORAI1Q96D31 301 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 AMELYQ99218 206 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 KCNG2Q9UJ96 466 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 IKZF2Q9UKS7 526 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 A0A0G2JK05 382 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 A0A1W2PQ09 198 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
LHX3-201ENST00000371746 CFL1P23528 166 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms