RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 ZNF788Q6ZQV5 615 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TAS1R1Q7RTX1 841 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SPRED1Q7Z699 444 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 FGF14Q92915 247 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 OR51I2Q9H344 312 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 RHCGQ9UBD6 479 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ZNF337Q9Y3M9 751 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 LAMB2P55268 1798 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 A0A1W2PPK0 400 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 H3BNX3 289 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 UBE2L6O14933 153 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ACOX3O15254 700 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 NOBOXO60393 691 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CYTIPO60759 359 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 EGR1P18146 543 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 EVX2Q03828 476 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 LTBQ06643 244 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 OXA1LQ15070 435 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ANKRD16Q6P6B7 361 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 HMGN2P46Q86SG4 172 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CLEC14AQ86T13 490 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 OR2Z1Q8NG97 314 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ZNF384Q8TF68 577 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 INTS14Q96SY0 518 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CCDC106Q9BWC9 280 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TMEM59LQ9UK28 342 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 APOL3O95236 402 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CD48P09326 243 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 RFC3P40938 356 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SBSNQ6UWP8 590 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TMEM150AQ86TG1 271 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 BHLHE23Q8NDY6 225 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 GLIS3Q8NEA6 775 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SLAMF9Q96A28 289 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ZMAT4Q9H898 229 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 APMAPQ9HDC9 416 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SNED1Q8TER0 1413 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 A0A1W2PRD5 423 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 A0A1W2PRF3 423 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 A0A1W2PRM7 423 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 GPR37O15354 613 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 XPNPEP2O43895 674 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 UBL3O95164 117 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 UTS2O95399 124 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 MBP02144 154 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ARNTP27540 789 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 BAXQ07812 192 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 OR5I1Q13606 314 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CD163Q86VB7 1156 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 HDAC8Q9BY41 377 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 POPDC3Q9HBV1 291 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PTTG3PQ9NZH4 202 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 EBF1Q9UH73 591 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ANKRD12Q6UB98 2062 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 FAM155BO75949 473 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 RNF4P78317 190 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 FADDQ13158 208 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 P2RY14Q15391 338 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TUSC1Q2TAM9 212 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CDH26Q8IXH8 852 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PRRC1Q96M27 445 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ZNF75AQ96N20 296 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 MTG2Q9H4K7 406 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 NT5DC2Q9H857 520 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 AGAP14A8MT82 685 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 DOK2O60496 412 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CREG1O75629 220 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TBXA2RP21731 343 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 HLA-DMAP28067 261 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 AGTR1P30556 359 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CDKN2BP42772 138 aa3.8□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CLINT1Q14677 625 aa3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms