RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 PIGLQ9Y2B2 252 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TESMINQ9Y4I5 508 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KCTD3Q9Y597 815 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FKBP7Q9Y680 259 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CARMIL3Q8ND23 1372 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FUOMA2VDF0 154 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 K7ESM1 405 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC17A3O00476 420 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SEMA7AO75326 666 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TRMUO75648 421 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFB4O95168 129 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CDRT1O95170 752 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 IFNA21P01568 189 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PROS1P07225 676 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LIPCP11150 499 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AKR1A1P14550 325 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 S100PP25815 95 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BDKRB2P30411 391 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GDI2P50395 445 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ERVK11-1P61568 191 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NAA20P61599 178 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAB11AP62491 216 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KCNJ2P63252 427 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BLOC1S1P78537 153 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 VAMP3Q15836 100 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAB11BQ15907 218 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PSMD5Q16401 504 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 QRICH1Q2TAL8 776 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL38Q2WGJ6 581 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 XKR7Q5GH72 579 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SPANXN3Q5MJ09 141 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 Q5PR19 223 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 IDNKQ5T6J7 187 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC8B1Q6J4K2 584 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 H3F3CQ6NXT2 135 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RHBDF2Q6PJF5 856 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CREB3L2Q70SY1 520 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFAF7Q7L592 441 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC29A4Q7RTT9 530 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AMIGO2Q86SJ2 522 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ITIH5Q86UX2 942 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM25Q86YD3 366 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRF4Q8IZF3 695 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ATPAF2Q8N5M1 289 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HORMAD2Q8N7B1 307 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF555Q8NEP9 628 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR2AK2Q8NG84 335 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR6K6Q8NGW6 343 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DOK4Q8TEW6 326 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CD101Q93033 1021 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ERGIC1Q969X5 290 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SDF2Q99470 211 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 S1PR3Q99500 378 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AIFM2Q9BRQ8 373 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC39A8Q9C0K1 460 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 COMMD5Q9GZQ3 224 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR51V1Q9H2C8 321 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ARMC7Q9H6L4 198 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NT5MQ9NPB1 228 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FZD3Q9NPG1 666 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS16Q9NQE7 514 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CYSLTR2Q9NS75 346 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MYRFQ9Y2G1 1151 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RYR2Q92736 4967 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UNC13CQ8NB66 2214 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CXorf65A6NEN9 183 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RNF212BA8MTL3 300 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DISC1C4P0D8 188 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 H7C2Y5 167 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KMOO15229 486 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DUX1O43812 170 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UGDHO60701 494 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SUPT7LO94864 414 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CR2P20023 1033 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 VAMP7P51809 220 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SELENOVP59797 346 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TSPAN5P62079 268 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC63Q05C16 580 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PLA2G7Q13093 441 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms