RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 TSPAN32Q96QS1 320 aa15.51■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 MCUBQ9NWR8 336 aa15.51■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 HAO2Q9NYQ3 351 aa15.51■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 GRHPRQ9UBQ7 328 aa15.51■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 EPXP11678 715 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 PITPNBP48739 271 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 CCR6P51684 374 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ACTC1P68032 377 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ACTA1P68133 377 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 EBPQ15125 230 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 BCL2L15Q5TBC7 163 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ZNF527Q8NB42 609 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 LHFPL5Q8TAF8 219 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 PMM1Q92871 262 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 NIPAL2Q9H841 368 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 AKR7A3O95154 331 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 IGKV3-11P04433 115 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 FBXO45P0C2W1 286 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 MEP1BQ16820 701 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 LIPNQ5VXI9 398 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 OR2I1PQ8NGU4 316 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 RFT1Q96AA3 541 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 GFI1Q99684 422 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 INPP5EQ9NRR6 644 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 KLHL21Q9UJP4 597 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 FLRT2O43155 660 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 CD14P08571 375 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 CXCR1P25024 350 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 MELKQ14680 651 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 COL19A1Q14993 1142 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 TMEM65Q6PI78 240 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 FAM122BQ7Z309 247 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 PPM1BO75688 479 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 FAM157BP0CG42 384 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ABCD3P28288 659 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 EVI2BP34910 448 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 RPS15P62841 145 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 LGALS3BPQ08380 585 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 PLA2G7Q13093 441 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 MFSD13AQ14CX5 517 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 MDGA2Q7Z553 956 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 OR8H3Q8N146 312 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 SLC46A1Q96NT5 459 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 GAL3ST1Q99999 423 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 KIF26BQ2KJY2 2108 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 CEP192Q8TEP8 1941 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 H0YC42 278 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 OGG1O15527 345 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 SLC19A2O60779 497 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 MZT2BQ6NZ67 158 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 KCNJ15Q99712 375 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 NUDT15Q9NV35 164 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 SEC14L5O43304 696 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 GLCEO94923 617 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 MT-ND4P03905 459 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ANKRD34CP0C6C1 535 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 TAS2R43P59537 309 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 SQSTM1Q13501 440 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 KCNK15Q9H427 330 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 FITM1A5D6W6 292 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 MAS1P04201 325 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 HIST1H2ABP04908 130 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 GIMD1P0DJR0 217 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 SRMP19623 302 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 NPR2P20594 1047 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 HLA-DMAP28067 261 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 PRPS1P60891 318 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 POU4F2Q12837 409 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 FAAP20Q6NZ36 180 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 Q7L0L9 218 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 FCRLAQ7L513 359 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 MS4A15Q8N5U1 240 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 HIST1H2ACQ93077 130 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 C8orf44Q96CB5 159 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 SLC22A11Q9NSA0 550 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ZNF224Q9NZL3 707 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 KCNG2Q9UJ96 466 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 VDAC3Q9Y277 283 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms