RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PDCL3Q9H2J4 239 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EGLN3Q9H6Z9 239 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ACKR4Q9NPB9 350 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NPIPA1Q9UND3 350 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AKT3Q9Y243 479 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCL27Q9Y4X3 112 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM169AQ9Y6X4 670 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PCNTO95613 3336 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PTPRDP23468 1912 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SBF2Q86WG5 1849 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PASKQ96RG2 1323 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A075B6Q4 140 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A0J9YW62 118 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A1W2PPQ1 181 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM170AA1A519 330 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC162PA2VCL2 907 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GOLGA6L10A6NI86 522 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTC36A6NLP5 189 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RFPL4AA6NLU0 287 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC17A2O00624 439 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PSMD3O43242 534 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLPP2O43688 288 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ECE2O60344 883 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ATP9AO75110 1047 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GLRA3O75311 464 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPR32O75388 356 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TACC1O75410 805 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CER1O95813 267 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PAHP00439 452 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GOT2P00505 430 aaKnown RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGHV3-48P01763 117 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GP1BAP07359 652 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FGF4P08620 206 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR4A8P0C604 315 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR8U8P0C7N1 319 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IRF1P10914 325 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 F3P13726 295 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HSD17B1P14061 328 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CPMP14384 443 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UBTFP17480 764 aaKnown RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DDCP20711 480 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COX7A1P24310 79 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ACKR3P25106 362 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PTPN4P29074 926 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADORA2BP29275 332 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPR183P32249 361 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DDIT3P35638 169 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAGEA5P43359 124 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPR15P49685 360 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRKAG1P54619 331 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CDH8P55286 799 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLDN8P56748 225 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ACTR3P61158 418 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPS18P62269 152 aaKnown RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CNBPP62633 177 aaKnown RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DCDP81605 110 aaKnown RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HMGCS1Q01581 520 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANGPT1Q15389 498 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NPTX1Q15818 432 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IMPG1Q17R60 797 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WASHC4Q2M389 1173 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ALFQ53S48 1182 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARMC12Q5T9G4 340 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NAA35Q5VZE5 725 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C18orf63Q68DL7 685 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLEC6AQ6EIG7 209 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ERAP2Q6P179 960 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRMT9Q6P2P2 845 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 POMZP3Q6PJE2 187 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LEKR1Q6ZMV7 388 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MOGAT3Q86VF5 341 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CRLF3Q8IUI8 442 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM58AQ8N1B3 248 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 STK40Q8N2I9 435 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GALNT15Q8N3T1 639 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GBGT1Q8N5D6 347 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR11G2Q8NGC1 345 aa-2.85□□□□□ -2.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms