RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 CLEC1BQ9P126 229 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00862A6NCI5 91 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 EFCAB7A8K855 629 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 C11orf98E9PRG8 122 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TEX46H3BTG2 121 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PPM1BO75688 479 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 KDM4BO94953 1096 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ABHD16AO95870 558 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 THEGLP0DJG4 465 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 UBL4AP11441 157 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CD46P15529 392 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CXCL2P19875 107 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LCN1P31025 176 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CAPZA2P47755 286 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GFERP55789 205 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HSF2Q03933 536 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DMWDQ09019 674 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GRK1Q15835 563 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MANEAQ5SRI9 462 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 Q6ZS52 159 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PMM1Q92871 262 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TSLPQ969D9 159 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TAAR8Q969N4 342 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC61Q9BV99 259 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SYT4Q9H2B2 425 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MMP25Q9NPA2 562 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 NANSQ9NR45 359 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CD207Q9UJ71 328 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SCML1Q9UN30 329 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0G2JNG1 304 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1B0GVI7 797 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 C17orf105B2RV13 164 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 M0R233 179 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RGS11O94810 467 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 UTS2O95399 124 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 WNT11O96014 354 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CD14P08571 375 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HPGDP15428 266 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TACR3P29371 465 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SDHAP31040 664 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 KIR3DL2P43630 455 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RABIFP47224 123 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CENPAP49450 140 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ART1P52961 327 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FOXL2P58012 376 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PRPS1P60891 318 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 YPEL5P62699 121 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SKP2Q13309 424 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HTR4Q13639 388 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CBFBQ13951 182 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 KIR2DS5Q14953 304 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CSRP2Q16527 193 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 Q499Y3 187 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CDC20BQ86Y33 519 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF563Q8TA94 476 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RLN3Q8WXF3 142 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TTC9Q92623 222 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.6□□□□□ -1.35
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