RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340369.3

XIRP1-201, Transcript of xin actin binding repeat containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene XIRP1, Length 6,460 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1-201ENST00000340369 CLMPQ9H6B4 373 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 FADS1O60427 444 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 NPBWR1P48145 328 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 RAB5CP51148 216 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 CLVS2Q5SYC1 327 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 STEAP3Q658P3 488 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 A0A0B4J2A0 478 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.66□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 GPR45Q9Y5Y3 372 aa11.66□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 IGHV3-9P01782 118 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 BAXQ07812 192 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 OR2G6Q5TZ20 316 aa11.66□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 OR6T1Q8NGN1 323 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 GTF2H4Q92759 462 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 OCSTAMPQ9BR26 566 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 SLC22A23A1A5C7 686 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 NXPH3O95157 252 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 AKR1C1Q04828 323 aa11.66□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 SLC35D2Q76EJ3 337 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 OR5M9Q8NGP3 310 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 TFAP2CQ92754 450 aa11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 IL37Q9NZH6 218 aa11.66□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 C17orf112F2Z3M2 114 aa11.65□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 C18orf63Q68DL7 685 aa11.65□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa11.65□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 M0R1B8 84 aa11.65□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 ZNF439Q8NDP4 499 aa11.65□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 SPCS2Q15005 226 aa11.65□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 HACD4Q5VWC8 232 aa11.65□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 CMIPQ8IY22 773 aa11.65□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 OR4A16Q8NH70 328 aa11.65□□□□□ -0.54
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XIRP1-201ENST00000340369 SLC41A2Q96JW4 573 aa11.65□□□□□ -0.54
XIRP1-201ENST00000340369 CDHR4A6H8M9 788 aa11.65□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF587BE7ETH6 402 aa11.65□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 H0Y8G0 127 aa11.65□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 S100A7P31151 101 aa11.65□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 TGM4P49221 684 aa11.65□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF836Q6ZNA1 936 aa11.65□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ITPKCQ96DU7 683 aa11.65□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CHST8Q9H2A9 424 aa11.65□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 MCRIP1C9JLW8 97 aa11.64□□□□□ -0.55
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