RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 ACOXLQ9NUZ1 547 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 A0A087WZY1 265 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SHISA3A0PJX4 238 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SNPHO15079 494 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 FZD7O75084 574 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 AKR7A3O95154 331 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 F8A1P23610 371 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 DLSTP36957 453 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ETV6P41212 452 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 EIF1P41567 113 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF45Q02386 682 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TLE3Q04726 772 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 MYBPHQ13203 477 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC190Q86UF4 302 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ASB10Q8WXI3 467 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 C5orf34Q96MH7 638 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM185BQ9H7F4 350 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 B9D1Q9UPM9 204 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 FKBP7Q9Y680 259 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SDK2Q58EX2 2172 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 A6NIZ1 184 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 NPIPA5E9PKD4 350 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 G3V3Y1 287 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 GPANK1O95872 356 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 OPN1LWP04000 364 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SERPINA7P05543 415 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF12P17014 697 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 EDNRAP25101 427 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PSMB10P40306 273 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CAV3P56539 151 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 RAP1BP61224 184 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 RAP1AP62834 184 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SIRPAP78324 504 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 IFITM3Q01628 133 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SELENBP1Q13228 472 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF684Q5T5D7 378 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PIP4P1Q86T03 277 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PARP16Q8N5Y8 322 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 OR6N2Q8NGY6 317 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ABHD4Q8TB40 342 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 GHSRQ92847 366 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ZBTB8AQ96BR9 441 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 INTS14Q96SY0 518 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 WDR76Q9H967 626 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 MARCH7Q9H992 704 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 NPIPA1Q9UND3 350 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CMAHPQ9Y471 501 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PNV4 684 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SLC22A23A1A5C7 686 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 C21orf140B9A014 251 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PSMD9O00233 223 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SLC16A7O60669 478 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 RAD1O60671 282 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SULT1C4O75897 302 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 NCR1O76036 304 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 LIFP15018 202 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 IFNGR1P15260 489 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ADH6P28332 368 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SHC1P29353 583 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TNFSF8P32971 234 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 MTNR1BP49286 362 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 DAP3P51398 398 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 RGS21Q2M5E4 152 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 H3F3CQ6NXT2 135 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 Q6ZNX1 250 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SMIM19Q96E16 107 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 KLHL15Q96M94 604 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 MNTQ99583 582 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 GPR87Q9BY21 358 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PNR3 127 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 RGS5O15539 181 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TNFSF15O95150 251 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CD1AP06126 327 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 OR8G3PP0DMU2 310 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PSKH1P11801 424 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CTLA4P16410 223 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 DPP4P27487 766 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CENPAP49450 140 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 OR2B6P58173 313 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 HSF1Q00613 529 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms