RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 MEIS3P1A6NDR6 274 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 PM20D2Q8IYS1 436 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 TPSD1Q9BZJ3 242 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 CA10Q9NS85 328 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 MMP17Q9ULZ9 603 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 GABARAPH6UMI1 98 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 SCDO00767 359 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 NSA2O95478 260 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 CD1CP29017 333 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 SDHAP31040 664 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 FNTBP49356 437 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 Q499Y3 187 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 NOX3Q9HBY0 568 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 UBQLN4Q9NRR5 601 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 THADAQ6YHU6 1953 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ITPKBP27987 946 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ADH7P40394 386 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 FNDC7Q5VTL7 733 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 SLC35D2Q76EJ3 337 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 GLB1L2Q8IW92 636 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 FTMTQ8N4E7 242 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF676Q8N7Q3 588 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 OR52B4Q8NGK2 314 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 RPS4Y2Q8TD47 263 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 B3GNT2Q9NY97 397 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF69Q9UC07 566 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 GMEB2Q9UKD1 530 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 PCNX3Q9H6A9 2034 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 DOK2O60496 412 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 SCO1O75880 301 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 CD1AP06126 327 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 PROS1P07225 676 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ESCO2Q56NI9 601 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 SLC25A36Q96CQ1 311 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 NXPE2Q96DL1 559 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 KLHDC7BQ96G42 594 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 SORCS2Q96PQ0 1159 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 MFRPQ9BY79 579 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ICMTO60725 284 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ICOSLGO75144 302 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ASAH2BP0C7U1 165 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 EFNB2P52799 333 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 TAS2R20P59543 309 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 LRRTM1Q86UE6 522 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 NSMAFQ92636 917 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 TAS2R10Q9NYW0 307 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 KCNG2Q9UJ96 466 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF264O43296 627 aa22.98■■□□□ 1.27
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HOXB3-201ENST00000311626 ABHD16AO95870 558 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ART1P52961 327 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 FOXL2P58012 376 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 HSF2Q03933 536 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 FGD2Q7Z6J4 655 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 CDC20BQ86Y33 519 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 GAL3ST1Q99999 423 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 MGAT4CQ9UBM8 478 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 TACSTD2P09758 323 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 IL10RAQ13651 578 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 TTLL10Q6ZVT0 673 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 PRSS35Q8N3Z0 413 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 LMX1AQ8TE12 382 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM106AQ96A25 262 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 SLC38A3Q99624 504 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ANXA2P2A6NMY6 339 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 NUDT14O95848 222 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 HLA-DQA2P01906 255 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 GUSBP08236 651 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 SLC37A1P57057 533 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 MARCH3Q86UD3 253 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 TCTN2Q96GX1 697 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 ACTR6Q9GZN1 396 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 RP1P56715 2156 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 SHISA7A6NL88 538 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 HCRTR2O43614 444 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 PNMTP11086 282 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 GUCA2AQ02747 115 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 TOR2AQ5JU69 321 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 LRRN1Q6UXK5 716 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 FAM71CQ8NEG0 241 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-201ENST00000311626 OR2G2Q8NGZ5 317 aa22.97■■□□□ 1.27
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