RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306167.11

MTM1-201, Transcript of myotubularin 1, humanhuman

TSL 5

Gene MTM1, Length 2,955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1-201ENST00000306167 UNC13CQ8NB66 2214 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 A0A1B0GW55 424 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 CIB4A0PJX0 185 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 A8MUA0 341 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 SOCS6O14544 535 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 OR1I1O60431 355 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 DUX4L2P0CJ85 424 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 DUX4L3P0CJ86 424 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 DUX4L4P0CJ87 422 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 DUX4L5P0CJ88 424 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 DUX4L6P0CJ89 424 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 DUX4L7P0CJ90 424 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 ACHEP22303 614 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 CALCRP30988 508 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 GDI2P50395 445 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 RPP38P78345 283 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 FGL1Q08830 312 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 ZNF678Q5SXM1 525 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 ANKRD12Q6UB98 2062 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 Q6ZWC4 215 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 PGAP1Q75T13 922 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 TRILQ7L0X0 811 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 TBC1D26Q86UD7 250 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 ADIPOR2Q86V24 386 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 STPG2Q8N412 459 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 LRRC17Q8N6Y2 441 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 UXS1Q8NBZ7 420 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 OR4F6Q8NGB9 312 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 AP3S1Q92572 193 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 PHF21AQ96BD5 680 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 OTUB2Q96DC9 234 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 C10orf90Q96M02 699 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 QRFPRQ96P65 431 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 GPR21Q99679 349 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 GABRG3Q99928 467 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 MED18Q9BUE0 208 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 MND1Q9BWT6 205 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 BBS2Q9BXC9 721 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 FN3KQ9H479 309 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 GALPQ9UBC7 116 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 DUX4Q9UBX2 424 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 IKZF3Q9UKT9 509 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 PPIL1Q9Y3C6 166 aa4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
MTM1-201ENST00000306167 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ASPDHA6ND91 283 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 NIPSNAP2O75323 286 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 WBP4O75554 376 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 FGF2P09038 288 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 NR2F6P10588 404 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 PIPP12273 146 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 NCK1P16333 377 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 EPORP19235 508 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 TCN2P20062 427 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 LHCGRP22888 699 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 TGFBR1P36897 503 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 RAG2P55895 527 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 OR4D2P58180 307 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.687e-6■□□□□ 9.9
MTM1-201ENST00000306167 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 HERVK_113P63132 956 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 CHIT1Q13231 466 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SYT16Q17RD7 645 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 UNC50Q53HI1 259 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 FAM76BQ5HYJ3 339 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 RNLSQ5VYX0 342 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 TMEM215Q68D42 235 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 AHSA2Q719I0 299 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 DTX2Q86UW9 622 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 STK40Q8N2I9 435 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 OR52N1Q8NH53 320 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 CD200R1Q8TD46 325 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 RHBDF1Q96CC6 855 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 Q96MT0 163 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 OR5M11Q96RB7 305 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SEC22CQ9BRL7 303 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 IFT27Q9BW83 186 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ERVK-6Q9BXR3 956 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ZFP64Q9NPA5 681 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ABCG2Q9UNQ0 655 aa4.59□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SLC22A23A1A5C7 686 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms