RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC39A9Q9NUM3 307 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 HCSTQ9UBK5 93 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 SOHLH1Q5JUK2 328 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 OGFOD3Q6PK18 319 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PRR14Q9BWN1 585 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 ULBP3Q9BZM4 244 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 WWTR1Q9GZV5 400 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CHST8Q9H2A9 424 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM71E1Q6IPT2 247 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PHYHIPQ92561 330 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 MARC2Q969Z3 335 aa22.32■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 DPP4P27487 766 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM41BQ5BJD5 291 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35D3Q5M8T2 416 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 GLYATL3Q5SZD4 288 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 RTL10Q7L3V2 364 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R3BQ86XI6 285 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 FGGYQ96C11 551 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB22AQ9UL26 194 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1024LP59773 190 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 BTG1P62324 171 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 MEP1BQ16820 701 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PRSS45Q7RTY3 260 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 MMP11P24347 488 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC48A1Q6P1K1 146 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 HIF1ANQ9NWT6 349 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 HCRTR1O43613 425 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 MFAP5Q13361 173 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PLPP7Q8NBV4 271 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 RASD2Q96D21 266 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 GFRA2O00451 464 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35A1P78382 337 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CDKN3Q16667 212 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 OLIG3Q7RTU3 272 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF511Q8NB15 262 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC7A6Q92536 515 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFA6P56556 154 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 DLEU7Q6UYE1 221 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 YIPF5Q969M3 257 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 TXN2Q99757 166 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CD63P08962 238 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PFN4Q8NHR9 129 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF32Q9H0A6 362 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 UBQLN3Q9H347 655 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 AIPO00170 330 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CBR1P16152 277 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 ISL1P61371 349 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 NKAIN3Q8N8D7 197 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 OR11A1Q9GZK7 315 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CLDN1O95832 211 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CD38P28907 300 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PMPCAQ10713 525 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 XKR7Q5GH72 579 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM207Q6UWW9 146 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 FJX1Q86VR8 437 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC43A2Q8N370 569 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 SMCO4Q9NRQ5 59 aa22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 AAED1Q7RTV5 226 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 EID2Q8N6I1 236 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM217Q8N7C4 229 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4N2Q8NGD1 307 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6M1Q8NGM8 313 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4Q3Q8NH05 313 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 MED30Q96HR3 178 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 GLCEO94923 617 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 F2RL1P55085 397 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF266Q14584 549 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 MYOTQ9UBF9 498 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52A1Q9UKL2 312 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CYB5BO43169 146 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 SLCO2B1O94956 709 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PIPP12273 146 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM122BQ7Z309 247 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 LPAL2Q16609 132 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 MFSD12Q6NUT3 480 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF167Q9H6Y7 350 aa22.29■■□□□ 1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 IMPA2O14732 288 aa22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms