RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.61□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TOX2Q96NM4 488 aa6.61□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.61□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.61□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TAC3Q9UHF0 121 aa6.61□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.61□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 A0A0B4J2A0 478 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MCIDASD6RGH6 385 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 AP4M1O00189 453 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PPM1DO15297 605 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF208O43345 1280 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZFPL1O95159 310 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RAB3DO95716 219 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CKMP06732 381 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 F3P13726 295 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PGAM2P15259 253 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ADRA2CP18825 462 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NDUFS1P28331 727 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 AQP2P41181 271 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PRKCZQ05513 592 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR2L13Q8N349 312 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MYLIPQ8WY64 445 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TSPAN11A1L157 253 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 A6NLC8 198 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 M0QYG6 137 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 EMC8O43402 210 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CTAG2O75638 210 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MAS1P04201 325 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 AMY2AP04746 511 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 INHAP05111 366 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 LIPCP11150 499 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MC3RP41968 323 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 HTR5AP47898 357 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CAV2P51636 162 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 DUSP2Q05923 314 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TGIF1Q15583 401 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TEX30Q5JUR7 227 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 BEND4Q6ZU67 534 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MOAP1Q96BY2 351 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SLC22A12Q96S37 553 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MYADMQ96S97 322 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OPA3Q9H6K4 179 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.6□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 A0A1W2PS29 197 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ARGFXA6NJG6 315 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 F8VVB4 439 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 F8VWA3 439 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 H7C4K7 107 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR1F1O43749 312 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 EOMESO95936 686 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MELTFP08582 738 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CTSAP10619 480 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RAB5CP51148 216 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF136P52737 540 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 EFNB2P52799 333 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TAS2R19P59542 299 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GAS6Q14393 721 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PON3Q15166 354 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NR0B2Q15466 257 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MST1LQ2TV78 715 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM205Q6UW68 189 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms