RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 AUP1Q9Y679 476 aa13.93□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 SEC14L2O76054 403 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 GPANK1O95872 356 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 GUSBP08236 651 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 OR12D1P0DN82 309 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 CRYBB2P43320 205 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 RAD52P43351 418 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 LOXL3P58215 753 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF154Q13106 437 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 FAM189A2Q15884 450 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 FXNQ16595 210 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ATG16L1Q676U5 607 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 C16orf62Q7Z3J2 963 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM99Q8N816 258 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC197Q8NCU1 140 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 OIT3Q8WWZ8 545 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 POLE3Q9NRF9 147 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL21Q9UJP4 597 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 FZR1Q9UM11 496 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGB4Q9UN71 923 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 RAP2CQ9Y3L5 183 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 WDR45Q9Y484 360 aa13.92□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 WDR91A4D1P6 747 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN24A6NM45 220 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN25C9JDP6 229 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 BIRC5O15392 142 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF35P13682 527 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 CCNA2P20248 432 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 UQCRC2P22695 453 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 MTNR1AP48039 350 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 CCL8P80075 99 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 SPANXN4Q5MJ08 99 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF563Q8TA94 476 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ROPN1LQ96C74 230 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ZG16BQ96DA0 208 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 NEURL3Q96EH8 262 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 GAL3ST1Q99999 423 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00470Q9BZP3 86 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 DPY30Q9C005 99 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 EXD2Q9NVH0 621 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 CACNG2Q9Y698 323 aa13.91□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM72A0PK05 275 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 AQP7P3A6NL99 342 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf100A8MU93 164 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 CLPXO76031 633 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 AGR2O95994 175 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF12P17014 697 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ARF1P84077 181 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 HMGN2P46Q86SG4 172 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 GPAT4Q86UL3 456 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 JAZF1Q86VZ6 243 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 XAGE5Q8WWM1 108 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 TEX37Q96LM6 180 aa13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SPCS1-201ENST00000233025 DSPPQ9NZW4 1301 aa13.9□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PPW3 197 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 E9PBE3 544 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 TRAPPC2LH3BP13 241 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 GPR37O15354 613 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF208O43345 1280 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 FOXH1O75593 365 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 AKR7A3O95154 331 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 P2RY4P51582 365 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 RPS23P62266 143 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf68Q2NKX9 166 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 DPY19L1Q2PZI1 675 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ALKBH6Q3KRA9 238 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ATAD3BQ5T9A4 648 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ANXA8L1Q5VT79 327 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 OGFOD2Q6N063 350 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 C11orf87Q6NUJ2 197 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 NIPAL3Q6P499 406 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 DDIT4LQ96D03 193 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 TIMD4Q96H15 378 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF75AQ96N20 296 aa13.89□□□□□ -0.19
SPCS1-201ENST00000233025 NUF2Q9BZD4 464 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms