RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640507.1

SPIN3-240, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,436 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-240	ENST00000640507	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	ZP4	Q12836	540 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	MUC15	Q8N387	334 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	OR2T12	Q8NG77	320 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	EMC6	Q9BV81	110 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	MED29	Q9NX70	200 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	USF3	Q68DE3	2245 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	ZNF726	A6NNF4	738 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	OR6A2	O95222	327 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	CH25H	O95992	272 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	ADORA3	P0DMS8	318 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	COX4I1	P13073	169 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	MICU2	Q8IYU8	434 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	NANS	Q9NR45	359 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	MOK	Q9UQ07	419 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507		M0R3G1	203 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	TNFRSF1B	P20333	461 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	TAS2R41	P59536	307 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	SELENOW	P63302	87 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	CARD17	Q5XLA6	110 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
SPIN3-240	ENST00000640507	C11orf98	E9PRG8	122 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	NDUFS7	O75251	213 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	OR5F1	O95221	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	LY6G6D	O95868	133 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	IGF2	P01344	180 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	IGKV3-15	P01624	115 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	IGLV1-44	P01699	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	CRYAA	P02489	173 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	MT-ND1	P03886	318 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	HIST1H2AB	P04908	130 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	HEXA	P06865	529 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	THRB	P10828	461 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	CBR1	P16152	277 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	OR1E2	P47887	323 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	TUBA1B	P68363	451 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	TUBA4A	P68366	448 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	TNK1	Q13470	666 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	DEF8	Q6ZN54	512 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	TUBA1A	Q71U36	451 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	SERPINI2	O75830	405 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-240	ENST00000640507	IFNGR1	P15260	489 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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