RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	TPMT	P51580	245 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC107	Q8WV48	283 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	ASB12	Q8WXK4	309 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	OR2A5	Q96R48	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	MNT	Q99583	582 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM60A	Q9NP50	221 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	OR6C68	A6NDL8	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	H2BFM	P0C1H6	154 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC2A5	P22732	501 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	LSS	P48449	732 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	CCR9	P51686	369 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	AKR1C2	P52895	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	CEBPG	P53567	150 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	S100A10	P60903	97 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	AKR1C1	Q04828	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	MARCH3	Q86UD3	253 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF681	Q96N22	645 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	TREM1	Q9NP99	234 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	HPF1	Q9NWY4	346 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNJ13	O60928	360 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	THBS1	P07996	1170 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF20	P17024	532 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	HSD11B1	P28845	292 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	POU3F4	P49335	361 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	CXADR	P78310	365 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	MLC1	Q15049	377 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	AICDA	Q9GZX7	198 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SPIN3-223	ENST00000639525	IFITM5	A6NNB3	132 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525		F5H5P2	479 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	CTNS	O60931	367 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF432	O94892	652 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC35E2	P0CK97	266 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC6A1	P30531	599 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	BTG1	P62324	171 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	LINC00303	Q3SY05	128 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525		Q499Y3	187 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	THAP6	Q8TBB0	222 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	SPACA5	Q96QH8	159 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	C5orf42	Q9H799	3197 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RGS13	O14921	159 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	CD14	P08571	375 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ADRB1	P08588	477 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	CTH	P32929	405 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF85	Q03923	595 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	CBFB	Q13951	182 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	EOGT	Q5NDL2	527 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	CD276	Q5ZPR3	534 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	CBLN3	Q6UW01	205 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	OR2L13	Q8N349	312 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF264	O43296	627 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	BRINP1	O60477	761 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	SC5D	O75845	299 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ITGA5	P08648	1049 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC2A1	P11166	492 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	MYF5	P13349	255 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF136	P52737	540 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB38	P57729	211 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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