RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	HSPA12A	O43301	675 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SUPT7L	O94864	414 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CPM	P14384	443 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	UCHL3	P15374	230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TACR3	P29371	465 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	GRIA1	P42261	906 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	UBE2E1	P51965	193 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	RBBP4	Q09028	425 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	GATS	Q8NAP1	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	OR10H3	O60404	316 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	H6PD	O95479	791 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	METTL18	O95568	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	YEATS4	O95619	227 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	NUDT14	O95848	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	LPL	P06858	475 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CD79A	P11912	226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	IMPDH2	P12268	514 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TNFSF4	P23510	183 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	HSD17B3	P37058	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC1A1	P43005	524 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	XK	P51811	444 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	DLX1	P56177	255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CRYM	Q14894	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	DECR1	Q16698	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PMM1	Q92871	262 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	FCMR	O60667	390 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	UTS2	O95399	124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	HLA-H	P01893	362 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	LIPA	P38571	399 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PMEL	P40967	661 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PRIM2	P49643	509 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TERF1	P54274	439 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	DYNLT1	P63172	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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