RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 COMTD1Q86VU5 262 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 MIER2Q8N344 545 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 RFLNBQ8N5W9 214 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 MGARPQ8TDB4 240 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf159Q96HA4 380 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL14Q9P2G3 628 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 CMAHPQ9Y471 501 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 C5orf58C9J3I9 102 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 MS4A18H0YCH9 400 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 HLA-HP01893 362 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 CDH15P55291 814 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 IL1RL1Q01638 556 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 TRIP10Q15642 601 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 MS4A18Q3C1V0 323 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 ALG10BQ5I7T1 473 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 SLC2A7Q6PXP3 512 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 UEVLDQ8IX04 471 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 C20orf196Q8IYI0 205 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 TCF21O43680 179 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 HPRP00739 348 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 LYNX1P0DP58 116 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 CBLP22681 906 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 UGT2A3Q6UWM9 527 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 RAB21Q9UL25 225 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 A0A087WUJ7 227 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 GSG1Q2KHT4 349 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 CARD17Q5XLA6 110 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC47A1Q96FL8 570 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF813Q6ZN06 617 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 C10orf111Q8N326 155 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 EPYCQ99645 322 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 MED29Q9NX70 200 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF224Q9NZL3 707 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRF-216ENST00000617451 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 POFUT2Q9Y2G5 429 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0B4J2E0 115 aa21.44■■□□□ 1.02
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