RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597023.1

PPFIA4-208, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 4, human

TSL 4

Gene PPFIA4, Length 496 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPFIA4-208	ENST00000597023	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	PLPP3	O14495	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	KRT34	O76011	436 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	LYPD3	O95274	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CH25H	O95992	272 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	C8B	P07358	591 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	TNFRSF1B	P20333	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CRYBA2	P53672	197 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NAAA	Q02083	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	PUDP	Q08623	228 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NPRL3	Q12980	569 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	KLF10	Q13118	480 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	VMAC	Q2NL98	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	MMEL1	Q495T6	779 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	REP15	Q6BDI9	236 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF613	Q6PF04	617 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	OR6S1	Q8NH40	331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	LRRC58	Q96CX6	371 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	FXYD1	O00168	92 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	MRAS	O14807	208 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CHP2	O43745	196 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	FMO6P	O60774	539 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CRYAA	P02489	173 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ADORA3	P0DMS8	318 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	GUCY1A3	Q02108	690 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CHRNB3	Q05901	458 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	COQ5	Q5HYK3	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	MDP1	Q86V88	176 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	SNX32	Q86XE0	403 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	SCAI	Q8N9R8	606 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	OR5J2	Q8NH18	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	SAR1A	Q9NR31	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CA10	Q9NS85	328 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF726	A6NNF4	738 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023		H7C417	338 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	IGLV1-44	P01699	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	IFNGR1	P15260	489 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	CBR1	P16152	277 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	BID	P55957	195 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	HGFAC	Q04756	655 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	PIGF	Q07326	219 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	SLC22A2	O15244	555 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	OR6A2	O95222	327 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	IFNA14	P01570	189 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	IGKV3-15	P01624	115 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	HLA-H	P01893	362 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	OR4A8	P0C604	315 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	UMPS	P11172	480 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	CD79A	P11912	226 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	SERPINF1	P36955	418 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPFIA4-208	ENST00000597023	MELK	Q14680	651 aa		13.51	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms