RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 NIT2Q9NQR4 276 aa13.77□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 CT45A8P0DMV1 189 aa13.77□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 CT45A9P0DMV2 189 aa13.77□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 TFPIP10646 304 aa13.77□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 INPP1P49441 399 aa13.77□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 CAPZA1P52907 286 aa13.77□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 RAB38P57729 211 aa13.77□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 HYAL4Q2M3T9 481 aa13.77□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 CT45A2Q5DJT8 189 aa13.77□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 C1orf189Q5VU69 101 aa13.77□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 KIAA0895LQ68EN5 471 aa13.77□□□□□ -0.21
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CTIF-205ENST00000587860 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
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CTIF-205ENST00000587860 SLC25A18Q9H1K4 315 aa13.77□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 ZNF576Q9H609 170 aa13.77□□□□□ -0.21
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CTIF-205ENST00000587860 MED28Q9H204 178 aa13.76□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 OR10A5Q9H207 317 aa13.76□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
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CTIF-205ENST00000587860 SERPINA12Q8IW75 414 aa13.75□□□□□ -0.21
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CTIF-205ENST00000587860 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa13.75□□□□□ -0.21
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CTIF-205ENST00000587860 THADAQ6YHU6 1953 aa13.75□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 A0A087WV62 115 aa13.75□□□□□ -0.21
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CTIF-205ENST00000587860 ORC5O43913 435 aa13.75□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 RAD1O60671 282 aa13.75□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 CD3GP09693 182 aa13.75□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 RNH1P13489 461 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 HK1P19367 917 aa13.75□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 MAP3K8P41279 467 aa13.75□□□□□ -0.21
CTIF-205ENST00000587860 C1QL3Q5VWW1 255 aa13.75□□□□□ -0.21
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