RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 EMC3Q9P0I2 261 aa5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 KLHL9Q9P2J3 617 aa5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 B3GAT1Q9P2W7 334 aa5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 BAIAP2Q9UQB8 552 aa5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 MEMO1Q9Y316 297 aa5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 FAM215AQ9Y5M1 114 aa5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 CLEC18AA5D8T8 446 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF716A6NP11 495 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 ZAR1LA6NP61 321 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 DLGAP1O14490 977 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 BHLHE40O14503 412 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 GPR171O14626 319 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 ARPC3O15145 178 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 IDH3BO43837 385 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 AGFG2O95081 481 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 PPP1R3DO95685 299 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 TGM6O95932 706 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 BCL10O95999 233 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 IGHMP01871 453 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 CD14P08571 375 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 RNF224P0DH78 156 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 HLA-DOBP13765 273 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 IFNGR1P15260 489 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 EPHA2P29317 976 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 SDHAP31040 664 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 GIPRP48546 466 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 SLC16A1P53985 500 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 ERVK-25P63136 954 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 ADORA2A-AS1P86434 159 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 CDK5Q00535 292 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 MYBPC1Q00872 1141 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 GINS1Q14691 196 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 PDK3Q15120 406 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 ACKR1Q16570 336 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 PGGHGQ32M88 737 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 GPR139Q6DWJ6 353 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 OR2A2Q6IF42 318 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 CLEC18BQ6UXF7 455 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 CREB3L2Q70SY1 520 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 SLC35D2Q76EJ3 337 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 LNX2Q8N448 690 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 MARVELD2Q8N4S9 558 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 IQCF1Q8N6M8 205 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 CLEC18CQ8NCF0 446 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 CYGBQ8WWM9 190 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 CCDC120Q96HB5 630 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 SLC38A2Q96QD8 506 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 MBOAT4Q96T53 435 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 TM9SF2Q99805 663 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 ADI1Q9BV57 179 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 GRIP2Q9C0E4 1043 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 TXNIPQ9H3M7 391 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 BCO1Q9HAY6 547 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 GP6Q9HCN6 339 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 GLRX2Q9NS18 164 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 FAM118AQ9NWS6 357 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 MED29Q9NX70 200 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 NBASA2RRP1 2371 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 RELNP78509 3460 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 MPDZO75970 2070 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 DOCK7Q96N67 2140 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 POLEQ07864 2286 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 A6NIZ1 184 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF8-210ENST00000574217 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms