RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 RAD51DO75771 328 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 AGR2O95994 175 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 G6PDP11413 515 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SLC9A3P48764 834 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CENPAP49450 140 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CCR4P51679 360 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 MAP2K6P52564 334 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SLC25A3Q00325 362 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 EMX2Q04743 252 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CCDC58Q4VC31 144 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SAXO2Q658L1 398 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CGB2Q6NT52 195 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 C6orf120Q7Z4R8 191 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CMIPQ8IY22 773 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 FBXL14Q8N1E6 418 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ZNF525Q8N782 197 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ZNF614Q8N883 585 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 VPS33AQ96AX1 596 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TMEM45BQ96B21 275 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ZNF347Q96SE7 839 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 INPP5KQ9BT40 448 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 MECRQ9BV79 373 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 PIF1Q9H611 641 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ASB6Q9NWX5 421 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 MKLN1Q9UL63 735 aa7.36□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 A0A087WXM4 84 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ZNF208O43345 1280 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 FZD7O75084 574 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 MATN1P21941 496 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ETV4P43268 484 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 HTR3AP46098 478 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 HAAOP46952 286 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 EFNA4P52798 201 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CASP9P55211 416 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 PHC1P78364 1004 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 BAMBIQ13145 260 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SLC17A1Q14916 467 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 GPR68Q15743 365 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 MST1LQ2TV78 715 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SLC22A25Q6T423 547 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 OR52N5Q8NH56 324 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 FAM168AQ92567 244 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 HPS1Q92902 700 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SGK3Q96BR1 496 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TESCQ96BS2 214 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 NEURL3Q96EH8 262 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SLC35G5Q96KT7 338 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 OR51I1Q9H343 314 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 KCNK9Q9NPC2 374 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 EXD2Q9NVH0 621 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.35□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa7.34□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CIB4A0PJX0 185 aa7.34□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 AGAP5A6NIR3 686 aa7.34□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 NDUFS8O00217 210 aa7.34□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TYROBPO43914 113 aa7.34□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SERPINI2O75830 405 aa7.34□□□□□ -1.23
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