RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 B9A039 149 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 M0R3G1 203 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 M0R3H8 397 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 FMO6PO60774 539 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 EDF1O60869 148 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 PDE5AO76074 875 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 OPN1SWP03999 348 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 C8BP07358 591 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 CSF3P09919 207 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 NQO1P15559 274 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 MTPNP58546 118 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 VLDLRP98155 873 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 HGFACQ04756 655 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 EFNB3Q15768 340 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 NPTX1Q15818 432 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 C6orf52Q5T4I8 152 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 HDXQ7Z353 690 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 C11orf65Q8NCR3 313 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 NUP37Q8NFH4 326 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 OR4F15Q8NGB8 312 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 TSPEARQ8WU66 669 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 MCHR1Q99705 422 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 ASPNQ9BXN1 380 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 PLK3Q9H4B4 646 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 MED29Q9NX70 200 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 B3GNT2Q9NY97 397 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 JMJD1CQ15652 2540 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 VWC2LB2RUY7 222 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 PLPP3O14495 311 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 LYPD3O95274 346 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 THY1P04216 161 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 OR4A8P0C604 315 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 THBS4P35443 961 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 ARR3P36575 388 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 PDLIM4P50479 330 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 PUDPQ08623 228 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 PMS2P3Q13401 168 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 ENTPD8Q5MY95 495 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 CARD17Q5XLA6 110 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 ZNF613Q6PF04 617 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 VHLLQ6RSH7 139 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 MDP1Q86V88 176 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 CCDC36Q8IYA8 594 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 OR4D11Q8NGI4 311 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 OR6T1Q8NGN1 323 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 VIPAS39Q9H9C1 493 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 NPHS2Q9NP85 383 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 TRIM33Q9UPN9 1127 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 TMEM129A0AVI4 362 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 NDUFS8O00217 210 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 ANGPT2O15123 496 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 CHP2O43745 196 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 SEC14L2O76054 403 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 IGHV4-31P0DP07 118 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 USF1P22415 310 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 GZMMP51124 257 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 CAMK2DQ13557 499 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 NFYCQ13952 458 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 CYP51A1Q16850 503 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 CYB5R2Q6BCY4 276 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 WDR88Q6ZMY6 472 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 ZNF627Q7L945 461 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 PXKQ7Z7A4 578 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 ANKS4BQ8N8V4 417 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 OR5J2Q8NH18 312 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 OR10A6Q8NH74 314 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 ZNF75AQ96N20 296 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 DOK1Q99704 481 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 ZNF442Q9H7R0 627 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 USP22Q9UPT9 525 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 NOX1Q9Y5S8 564 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 FKBP7Q9Y680 259 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 SVEP1Q4LDE5 3571 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 ZNF726A6NNF4 738 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 FBP2O00757 339 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 MT-ATP6P00846 226 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 CD247P20963 164 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 AHCYP23526 432 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 CAPZA2P47755 286 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 PPOXP50336 477 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 ZP4Q12836 540 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 NPRL3Q12980 569 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 CHRFAM7AQ494W8 412 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-229ENST00000551936 METTL21CQ5VZV1 264 aa12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms