RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	BAG5	Q9UL15	447 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	LY6G6D	O95868	133 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	IFNA14	P01570	189 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	HLA-DOB	P13765	273 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CDKN1A	P38936	164 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	TNK1	Q13470	666 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ZNF74	Q16587	644 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	REP15	Q6BDI9	236 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	SNX32	Q86XE0	403 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	OR5J2	Q8NH18	312 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	C10orf82	Q8WW14	230 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CRLF2	Q9HC73	371 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	SLC35F4	A4IF30	521 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	KRT34	O76011	436 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	PDE5A	O76074	875 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CRYAA	P02489	173 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	THRB	P10828	461 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	BMP4	P12644	408 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CBR1	P16152	277 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CHRNB3	Q05901	458 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	RNF217	Q8TC41	542 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	LIPH	Q8WWY8	451 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	PROX1	Q92786	737 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	TXNDC15	Q96J42	360 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137		A0A096LPE4	126 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PPZ6	126 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	LRRN3	E7EW58	273 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CCDC22	O60826	627 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	NDUFS7	O75251	213 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	OR5F1	O95221	314 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CH25H	O95992	272 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	TSPAN19	P0C672	248 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CBL	P22681	906 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	KDELR2	P33947	212 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ARR3	P36575	388 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ACVR1B	P36896	505 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	FABP6	P51161	128 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	DSCR9	P59020	149 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	NAAA	Q02083	359 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	MST1L	Q2TV78	715 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CARM1	Q86X55	608 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	NUP37	Q8NFH4	326 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	OR2T12	Q8NG77	320 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	OR6X1	Q8NH79	312 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	EMC6	Q9BV81	110 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	REG4	Q9BYZ8	158 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	NANS	Q9NR45	359 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	MED29	Q9NX70	200 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	MOK	Q9UQ07	419 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CS-223	ENST00000551137	ZNF726	A6NNF4	738 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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