RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 SAGP10523 405 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 THRBP10828 461 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 IFI30P13284 250 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 HLA-DOBP13765 273 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 HSD17B1P14061 328 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 MPGP29372 298 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 CAPZA2P47755 286 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAM2Q15035 370 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 HIKESHIQ53FT3 197 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 FGD3Q5JSP0 725 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF730Q6ZMV8 503 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 RRM2BQ7LG56 351 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 PIK3C3Q8NEB9 887 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 MCUR1Q96AQ8 359 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 HS6ST2Q96MM7 605 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 PRSS27Q9BQR3 290 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 C20orf141Q9NUB4 165 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 B3GAT1Q9P2W7 334 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF229Q9UJW7 825 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 RCE1Q9Y256 329 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 DSCAMO60469 2012 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A096LPE4 126 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PPR1 153 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PPZ6 126 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PRG6 482 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 MS4A18H0YCH9 400 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 KLF4O43474 513 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SEC14L2O76054 403 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PDE5AO76074 875 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 OR7A10O76100 309 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 STAMBPO95630 424 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 RAF1P04049 648 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 IFNGR1P15260 489 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 FUT1P19526 365 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CALB2P22676 271 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ART1P52961 327 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 BIDP55957 195 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 BSPH1Q075Z2 132 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CAMK2DQ13557 499 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 MELKQ14680 651 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 MS4A18Q3C1V0 323 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TIMM23BQ5SRD1 257 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ADAM5Q6NVV9 412 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PAMR1Q6UXH9 720 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CYP2R1Q6VVX0 501 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 RINLQ6ZS11 566 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC35D2Q76EJ3 337 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 P2RY8Q86VZ1 359 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 NRMQ8IXM6 262 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 OFCC1Q8IZS5 231 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM86B1Q8N7N1 296 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TXNDC15Q96J42 360 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 OR2M2Q96R28 347 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM53CQ9NYF3 392 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 POU2F3Q9UKI9 436 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 A4GNTQ9UNA3 340 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF115Q9Y4L5 304 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ENPP4Q9Y6X5 453 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC35F4A4IF30 521 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 DIRAS1O95057 198 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 WNT11O96014 354 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PLAUP00749 431 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 F13BP05160 661 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ITGA2P17301 1181 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CSNK1A1P48729 337 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 IST1P53990 364 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PRPS1P60891 318 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 GABRA6Q16445 453 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CEACAM16Q2WEN9 425 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PXKQ7Z7A4 578 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CDK20Q8IZL9 346 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 C17orf78Q8N4C9 275 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 OR1K1Q8NGR3 316 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 BPIFA2Q96DR5 249 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CCL19Q99731 98 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF426Q9BUY5 554 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ULBP2Q9BZM5 246 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CRLF2Q9HC73 371 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC17A5Q9NRA2 495 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 AMDHD2Q9Y303 409 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms