RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524705.2

BBS1-205, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 3

Gene BBS1, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-205	ENST00000524705	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.37	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.37	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	PTPRB	P23467	1997 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705		A0A0J9YW62	118 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705		A0A1W2PPW3	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705		H0YC42	278 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SULT2B1	O00204	365 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	CCRL2	O00421	344 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	XKRY	O14609	159 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	EFS	O43281	561 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	LRRTM2	O43300	516 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	AIRE	O43918	545 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	RAMP1	O60894	148 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	GLCE	O94923	617 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	GABARAP	O95166	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	GPANK1	O95872	356 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	BCL10	O95999	233 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	LALBA	P00709	142 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	REN	P00797	406 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	IGHM	P01871	453 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	TF	P02787	698 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SCG5	P05408	212 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SP1	P08047	785 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	CELA3A	P09093	270 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	IFNGR1	P15260	489 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	GADD45A	P24522	165 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	GDF1	P27539	372 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	TGFBR1	P36897	503 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	CENPA	P49450	140 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	RGS6	P49758	472 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	P2RY4	P51582	365 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SLC25A1	P53007	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	WNT4	P56705	351 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SOX8	P57073	446 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	VBP1	P61758	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	NCS1	P62166	190 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	RAC1	P63000	192 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SLC35A1	P78382	337 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	ARG2	P78540	354 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	HSF1	Q00613	529 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	ZNF85	Q03923	595 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	PUDP	Q08623	228 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	FOXO1	Q12778	655 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	CDC20	Q12834	499 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	MFAP5	Q13361	173 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SPCS2	Q15005	226 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	ETFDH	Q16134	617 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SSX1	Q16384	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	OTP	Q5XKR4	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SSX6	Q7RTT6	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	ZNF511	Q8NB15	262 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	OR2T4	Q8NH00	348 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-205	ENST00000524705	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71

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