RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2T33Q8NG76 320 aa20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF122Q9H9V4 155 aa20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 C8orf4Q9NR00 106 aa20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 AASSQ9UDR5 926 aa20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF175Q9Y473 711 aa20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 ZGRF1Q86YA3 2104 aa20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 ZAR1LA6NP61 321 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR1O75083 606 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 UQCRFS1P47985 274 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 BIDP55957 195 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 MYBPC1Q00872 1141 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 PGGHGQ32M88 737 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM122BQ7Z309 247 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 OR4K13Q8NH42 304 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 ADI1Q9BV57 179 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 TVP23BQ9NYZ1 205 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 GTF3C1Q12789 2109 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 CHD6Q8TD26 2715 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PRG6 482 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 B8ZZF3 427 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 GABRA1P14867 456 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 NOS3P29474 1203 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 LGALS3BPQ08380 585 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXF2Q12947 444 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 MCEMP1Q8IX19 187 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 GRHPRQ9UBQ7 328 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR52Q9Y2T5 361 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-208ENST00000524325 TAF11Q15544 211 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKDD1AQ495B1 522 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC43A2Q8N370 569 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 NAXEQ8NCW5 288 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 WNT2BQ93097 391 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC35F4A4IF30 521 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 VAMP5O95183 116 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 BCL10O95999 233 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ACVR1BP36896 505 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 SELENOPP49908 381 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 SIRPAP78324 504 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 PMPCAQ10713 525 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 CAMK2DQ13557 499 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 LNX2Q8N448 690 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 SYT14Q8NB59 555 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 CYB561A3Q8NBI2 242 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 TXNIPQ9H3M7 391 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 FANCFQ9NPI8 374 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 GMPPBQ9Y5P6 360 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 CD8B2A6NJW9 211 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHV3-9P01782 118 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 GLI4P10075 376 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 SMSP52788 366 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL27P61353 136 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 MESTQ5EB52 335 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ARMC4Q5T2S8 1044 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 SDR9C7Q8NEX9 313 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52E2Q8NGJ4 325 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ASB10Q8WXI3 467 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 C12orf49Q9H741 205 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 E9PQ18 207 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF9O43307 516 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 GNLYP22749 145 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC16A1P53985 500 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 POU4F3Q15319 338 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 SLX4IPQ5VYV7 408 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 NIPAL3Q6P499 406 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF555Q8NEP9 628 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 TFAP2CQ92754 450 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 RDH12Q96NR8 316 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 IL4I1Q96RQ9 567 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 NMNAT3Q96T66 252 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC25A19Q9HC21 320 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms