RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519426.5

NBN-208, Transcript of nibrin, human

TSL 4

Gene NBN, Length 535 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NBN-208	ENST00000519426	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	XKRX	Q6PP77	449 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	TMEM123	Q8N131	208 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	TXNDC15	Q96J42	360 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	PIGM	Q9H3S5	423 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426		A8MXE2	369 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	MSTN	O14793	375 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	NDUFB2	O95178	105 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ANPEP	P15144	967 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ZNF23	P17027	643 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	GSTM3	P21266	225 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ARHGDIA	P52565	204 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	CLDN17	P56750	224 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	PPP2R2B	Q00005	443 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	TFF3	Q07654	80 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	RCN1	Q15293	331 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ACKR1	Q16570	336 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	RFX4	Q33E94	735 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	FAM122B	Q7Z309	247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	OR6X1	Q8NH79	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	OR2M2	Q96R28	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	UCK2	Q9BZX2	261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	OR52D1	Q9H346	318 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	MED29	Q9NX70	200 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426		A0A1W2PRG6	482 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	PDLIM1	O00151	329 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	AGFG2	O95081	481 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	CD14	P08571	375 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	PCYT1A	P49585	367 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	SELENOP	P49908	381 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	RUNX1T1	Q06455	604 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	TAF11	Q15544	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	AAED1	Q7RTV5	226 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	STK32C	Q86UX6	486 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	PARP8	Q8N3A8	854 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ZNF519	Q8TB69	540 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	FANK1	Q8TC84	345 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ASB10	Q8WXI3	467 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	APH1A	Q96BI3	265 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	SAMD8	Q96LT4	415 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	MALT1	Q9UDY8	824 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	PROCR	Q9UNN8	238 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	SLC35F4	A4IF30	521 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	BHLHE40	O14503	412 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	ARPC3	O15145	178 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	MGRN1	O60291	552 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NBN-208	ENST00000519426	BAG2	O95816	211 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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