RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 RAPGEF5Q92565 580 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SENP8Q96LD8 212 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF607Q96SK3 696 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 RIT2Q99578 217 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 DPH7Q9BTV6 452 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 DEFB126Q9BYW3 111 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 IKZF5Q9H5V7 419 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 LY9Q9HBG7 655 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NANSQ9NR45 359 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TFR2Q9UP52 801 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 HYOU1Q9Y4L1 999 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PQ72 361 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 BTNL10A8MVZ5 291 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 HAS3O00219 553 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MAGEB3O15480 346 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 KLRC4O43908 158 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 GPX5O75715 221 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NDUFB10O96000 172 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 RPSAP08865 295 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NQO1P15559 274 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 KLK2P20151 261 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NT5EP21589 574 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TBXA2RP21731 343 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 VDAC1P21796 283 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CASP1P29466 404 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 UGT1A3P35503 534 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MAGEA8P43361 318 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 RPL29P47914 159 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 P2RY4P51582 365 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NCALDP61601 193 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CUL1Q13616 776 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 DPYSL3Q14195 570 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 LAGE3Q14657 143 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SYPL1Q16563 259 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 KCTD16Q68DU8 428 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SPINK14Q6IE38 97 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 OR5M10Q6IEU7 315 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 C16orf62Q7Z3J2 963 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 OR51G2Q8NGK0 314 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NELFBQ8WX92 580 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 DYNLL2Q96FJ2 89 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 FAHD2AQ96GK7 314 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CAPZA3Q96KX2 299 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 C12orf66Q96MD2 445 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ALS2CR12Q96Q35 445 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CYP2S1Q96SQ9 504 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TXN2Q99757 166 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 EDEM2Q9BV94 578 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM109Q9BVC6 243 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 AIPL1Q9NZN9 384 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 Q9UF83 564 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 KLHL21Q9UJP4 597 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 EML5Q05BV3 1969 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 GPR89AB7ZAQ6 455 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 E7ENQ6 273 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 PES1O00541 588 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 RAD51CO43502 376 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 LATO43561 262 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MTX2O75431 263 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 RHOBTB1O94844 696 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 GPR89BP0CG08 455 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CPN1P15169 458 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 PGCP20142 388 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 AP3M2P53677 418 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP10-5P60370 271 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 IL17AQ16552 155 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SLC5A12Q1EHB4 618 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 OR52E8Q6IFG1 317 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 C8orf74Q6P047 294 aa3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms