RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CD1EP15812 388 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF24P17028 368 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 HTR1EP28566 365 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 TFPI2P48307 235 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ACLYP53396 1101 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CDH6P55285 790 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP10-12P60413 245 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 B3GNT7Q8NFL0 401 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 FANK1Q8TC84 345 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 FAM151AQ8WW52 585 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 SLC38A4Q969I6 547 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 MCUR1Q96AQ8 359 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 FCRL1Q96LA6 429 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PLSCR3Q9NRY6 295 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 GOSR2O14653 212 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV1-47P01700 117 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 FUT3P21217 361 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 TGM3Q08188 693 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 HERPUD1Q15011 391 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF79Q15937 498 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 IL17AQ16552 155 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC66Q68CR7 880 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 VN1R2Q8NFZ6 395 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 ELMO1Q92556 727 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 ARPC1AQ92747 370 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 OR11A1Q9GZK7 315 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 TMED5Q9Y3A6 229 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 FTH1P02794 183 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 CT62P0C5K7 136 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 CHTF8P0CG12 524 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF43P17038 809 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 NPBWR2P48146 333 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 NUP107P57740 925 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 PEX26Q7Z412 305 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM135Q86UB9 458 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 HES7Q9BYE0 225 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 USP47Q96K76 1375 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 USP27XA6NNY8 438 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 KLLNB2CW77 178 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 KRT6AP02538 564 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 SFTPCP11686 197 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 GALP22466 123 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 RORAP35398 523 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 SYKP43405 635 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 CAV2P51636 162 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 ACVR1Q04771 509 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 GPNMBQ14956 572 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 SLC8B1Q6J4K2 584 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD6LQ8IWD5 586 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 FAM81AQ8TBF8 368 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35E1Q96K37 410 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 SRMSQ9H3Y6 488 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 SLC31A2O15432 143 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 WNT4P56705 351 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 NDPQ00604 133 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 PAGE3Q5JUK9 113 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 LHFPL3Q86UP9 236 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 PDFQ9HBH1 243 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 LSM1O15116 133 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 CLOCKO15516 846 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 RRM2P31350 389 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 C21orf59P57076 290 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 GPX6P59796 221 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 GNB2P62879 340 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 CNIH2Q6PI25 160 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 IL34Q6ZMJ4 242 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 LIX1Q8N485 282 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF4L2Q8NA75 395 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 OR10G9Q8NGN4 311 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 RHEBL1Q8TAI7 183 aa5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms