RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491203.5

CNOT4-210, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene CNOT4, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-210ENST00000491203 P2RY4P51582 365 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 PER3P56645 1201 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 H3F3AP84243 136 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 TSPAN31Q12999 210 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 TAF11Q15544 211 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 GPAT4Q86UL3 456 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 STK32CQ86UX6 486 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 CCDC103Q8IW40 242 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 OR51A7Q8NH64 312 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 ABHD3Q8WU67 409 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 OXGR1Q96P68 337 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 FEVQ99581 238 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 GPA33Q99795 319 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 PSD2Q9BQI7 771 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RNF122Q9H9V4 155 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 GLRX2Q9NS18 164 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 EMC3Q9P0I2 261 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RNF114Q9Y508 228 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 NBASA2RRP1 2371 aa7.55□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 POLEQ07864 2286 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 A0A1W2PNV4 684 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 C11orf98E9PRG8 122 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 CDC42EP2O14613 210 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 GPR171O14626 319 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 LRRTM2O43300 516 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RNF13O43567 381 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RAMP1O60894 148 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RCBTB2O95199 551 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 TIMP3P35625 211 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 AQP2P41181 271 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 SLC16A1P53985 500 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 PRPS1P60891 318 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 PUDPQ08623 228 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 PMPCAQ10713 525 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 ZP4Q12836 540 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 CDK5R2Q13319 367 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 SLC17A1Q14916 467 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 PDK3Q15120 406 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 ZBED5Q49AG3 693 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 ALG10Q5BKT4 473 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 MTFR2Q6P444 385 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 FJX1Q86VR8 437 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 UEVLDQ8IX04 471 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 KDM8Q8N371 416 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 FANK1Q8TC84 345 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RND1Q92730 232 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 EME1Q96AY2 570 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 UCK2Q9BZX2 261 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 GP6Q9HCN6 339 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 INIPQ9NRY2 104 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 BSNQ9UPA5 3926 aa7.54□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.53□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.53□□□□□ -1.2
CNOT4-210ENST00000491203 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms