RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.94□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 CARD17Q5XLA6 110 aa14.94□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 TMEM19Q96HH6 336 aa14.94□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.94□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 PNPOQ9NVS9 261 aa14.94□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.94□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 TMEM247A6NEH6 219 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 WNT9BO14905 357 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ANP32DO95626 131 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 GRPRP30550 384 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 HILS1P60008 231 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 GALK2Q01415 458 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 USP43Q70EL4 1123 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 TEX29Q8N6K0 151 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 SLC38A4Q969I6 547 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 YIPF5Q969M3 257 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 TAAR8Q969N4 342 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 C12orf10Q9HB07 376 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.93□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 SDHDO14521 159 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 PNPP00491 289 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 EPHA1P21709 976 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 BGNP21810 368 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 CBLP22681 906 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 LRP11Q86VZ4 500 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 UEVLDQ8IX04 471 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 MGARPQ8TDB4 240 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 SLC35B4Q969S0 331 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF75AQ96N20 296 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 JMJD8Q96S16 334 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 FZR1Q9UM11 496 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 RAB36O95755 333 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 IL6P05231 212 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ZCCHC18P0CG32 403 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 LMO4P61968 165 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 MYBPC1Q00872 1141 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 STX3Q13277 289 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 FXNQ16595 210 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 LRR1Q96L50 414 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 EMC6Q9BV81 110 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF385DQ9H6B1 395 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 DUSP13Q9UII6 198 aa14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 A0A1W2PPW3 197 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 MS4A18H0YCH9 400 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 NAT2P11245 290 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ANPEPP15144 967 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 LSP1P33241 339 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 GIPRP48546 466 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ARFIP2P53365 341 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 AQP5P55064 265 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 RAB1AP62820 205 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 MS4A18Q3C1V0 323 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 GTDC1Q4AE62 458 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF627Q7L945 461 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 SNX32Q86XE0 403 aa14.91□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.9□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 TM9SF1O15321 606 aa14.9□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 KCNAB3O43448 404 aa14.9□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 NCR1O76036 304 aa14.9□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 UBL3O95164 117 aa14.9□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 HPRP00739 348 aa14.9□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 HLA-DOBP13765 273 aa14.9□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 B4GALT1P15291 398 aa14.9□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 LIMS1P48059 325 aa14.9□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PKDCC-208ENST00000490302 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms