RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488452.5

NELFA-215, Transcript of negative elongation factor complex member A, humanhuman

TSL 4

Gene NELFA, Length 560 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFA-215ENST00000488452 RAD21L1Q9H4I0 556 aa13.08□□□□□ -0.32
NELFA-215ENST00000488452 A4GALTQ9NPC4 353 aa13.08□□□□□ -0.32
NELFA-215ENST00000488452 C5orf58C9J3I9 102 aa13.07□□□□□ -0.32
NELFA-215ENST00000488452 CLIC1O00299 241 aa13.07□□□□□ -0.32
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NELFA-215ENST00000488452 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
NELFA-215ENST00000488452 SEC24CP53992 1094 aa13.04□□□□□ -0.32
NELFA-215ENST00000488452 RPS23P62266 143 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
NELFA-215ENST00000488452 RAB1AP62820 205 aa13.04□□□□□ -0.32
NELFA-215ENST00000488452 GALK2Q01415 458 aa13.04□□□□□ -0.32
NELFA-215ENST00000488452 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
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