RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486260.5

THBS3-207, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 5

Gene THBS3, Length 1,763 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-207ENST00000486260 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 Q96M85 177 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 FAM215AQ9Y5M1 114 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 CD8B2A6NJW9 211 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 CLIC3O95833 236 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 FCGR2AP12318 317 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 NOS3P29474 1203 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 CAPGP40121 348 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 RPS6KA3P51812 740 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 SLC16A1P53985 500 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 TFAP2CQ92754 450 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 WNT2BQ93097 391 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 RASD2Q96D21 266 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 EMC6Q9BV81 110 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 RNF122Q9H9V4 155 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 H0YAE9 185 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 ARPC3O15145 178 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 BCL10O95999 233 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 IGHMP01871 453 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 SDHAP31040 664 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 GGT2P36268 569 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 HSPA13P48723 471 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 CLDN17P56750 224 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 PDK3Q15120 406 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 TTC23Q5W5X9 447 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 C12orf73Q69YU5 71 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 MCEMP1Q8IX19 187 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 TUSC5Q8IXB3 177 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 ASB10Q8WXI3 467 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 PITX2Q99697 317 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 M0R129 80 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 SLC2A10O95528 541 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 GNAO1P09471 354 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 NTF4P34130 210 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 GRK5P34947 590 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 ACVR1BP36896 505 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 BIDP55957 195 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 RUNX1T1Q06455 604 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 OR4K13Q8NH42 304 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 UBE2FQ969M7 185 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 TEX12Q9BXU0 123 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 BCO1Q9HAY6 547 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 SLC35F4A4IF30 521 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 IMPA2O14732 288 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 IDH3BO43837 385 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 TXNDC12O95881 172 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 HMGN1P05114 100 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 TLE1Q04724 770 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 KEAP1Q14145 624 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 SNAPC1Q16533 368 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 MESTQ5EB52 335 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 CASP12Q6UXS9 341 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 ZNF519Q8TB69 540 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 FAM81AQ8TBF8 368 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 TM9SF2Q99805 663 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 EMC3Q9P0I2 261 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 ZNF724A8MTY0 619 aa14.68□□□□□ -0.06
THBS3-207ENST00000486260 B8ZZF3 427 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms