RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 S1PR1P21453 382 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 LCN1P31025 176 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 ARG2P78540 354 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 CD226Q15762 336 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 SYT9Q86SS6 491 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 NOXA1Q86UR1 476 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM99Q8N816 258 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 TEAD3Q99594 435 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1B0GV50 99 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 CENPBD1B2RD01 187 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRTM2O43300 516 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 UPK1BO75841 260 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 STK17BO94768 372 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF20P17024 532 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 SSR4P51571 173 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 USP51Q70EK9 711 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 GABARAPL3Q9BY60 117 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 MED29Q9NX70 200 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 CMAHPQ9Y471 501 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 PLXNA3P51805 1871 aa8.81□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 MEIOCA2RUB1 952 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 YKT6O15498 198 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 SEC14L2O76054 403 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 CD14P08571 375 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 NAT1P18440 290 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 VAMP1P23763 118 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 IDUAP35475 653 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 SOX18P35713 384 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 DLSTP36957 453 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 CLDN12P56749 244 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 GNRHR2Q96P88 292 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 FLRT3Q9NZU0 649 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PQ09 198 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 C5orf51A6NDU8 294 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 PRH1P02810 166 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 CCL11P51671 97 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 AGAP6Q5VW22 663 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC22A10Q63ZE4 541 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 STEAP3Q658P3 488 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 OR1J4Q8NGS1 313 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 ORAI1Q96D31 301 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 TM4SF19Q96DZ7 209 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 AGAP4Q96P64 663 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 EMC3Q9P0I2 261 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 HTR2AP28223 471 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGDIBP52566 201 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 BIDP55957 195 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 GLO1Q04760 184 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRC18Q8N456 261 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 OR8D4Q8NGM9 314 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 GHSRQ92847 366 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 GUCD1Q96NT3 240 aa8.8□□□□□ -1
PTPRVP-201ENST00000482597 INTS14Q96SY0 518 aa8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms