RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 HIST1H2ABP04908 130 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 UMPSP11172 480 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 CD53P19397 219 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 BSPH1Q075Z2 132 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 KEAP1Q14145 624 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ACKR1Q16570 336 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 PHYHD1Q5SRE7 291 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 PIK3C3Q8NEB9 887 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ANKK1Q8NFD2 765 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 OR1K1Q8NGR3 316 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 HIST1H2ACQ93077 130 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 MBD6Q96DN6 1003 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 C7orf34Q96L11 122 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 UBTD1Q9HAC8 227 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 GPR35Q9HC97 309 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 MED31Q9Y3C7 131 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ENPP4Q9Y6X5 453 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 CADP27708 2225 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 RNF13O43567 381 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ART1P52961 327 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 TRAM2Q15035 370 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 SPATS1Q496A3 300 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 HIKESHIQ53FT3 197 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 CARD17Q5XLA6 110 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 HMBOX1Q6NT76 420 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 SLC35D2Q76EJ3 337 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 C20orf196Q8IYI0 205 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 GPR137CQ8N3F9 429 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 LRR1Q96L50 414 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 AMDHD2Q9Y303 409 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 RNF115Q9Y4L5 304 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ARPC2O15144 300 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 CD3EP07766 207 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN19P0C672 248 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 IFNGR1P15260 489 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 CALB2P22676 271 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ZNF83P51522 516 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 IQCCQ4KMZ1 466 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 RINLQ6ZS11 566 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 BCAS4Q8TDM0 211 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 FOXC2Q99958 501 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 NELFAQ9H3P2 528 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 NDUFAF4Q9P032 175 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 AKAP9Q99996 3911 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 OTOGQ6ZRI0 2925 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 A0A087WUU8 490 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ZNF726A6NNF4 738 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 M0R3G1 203 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 SEMG1P04279 462 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 IFI30P13284 250 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 BIDP55957 195 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ARF1P84077 181 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 CAMK2DQ13557 499 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 DEFB113Q30KQ7 82 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 TBRG1Q3YBR2 411 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ADAM5Q6NVV9 412 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 TBPL2Q6SJ96 375 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 CYP4Z1Q86W10 505 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 NRMQ8IXM6 262 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 BPIFA2Q96DR5 249 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 PYURFQ96I23 114 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 NSMCE2Q96MF7 247 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 CXXC4Q9H2H0 198 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 CRLF2Q9HC73 371 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 HTR3EA5X5Y0 456 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 HS3ST1O14792 307 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 CLOCKO15516 846 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 MAKP20794 623 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 AQP2P41181 271 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PRPS1P60891 318 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 VLDLRP98155 873 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PRKCDQ05655 676 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 CEACAM16Q2WEN9 425 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 C20orf204Q6ZNR8 217 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 LURAP1LQ8IV03 231 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 KBTBD8Q8NFY9 601 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 OR6X1Q8NH79 312 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 NEUROG1Q92886 237 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD19PQ9H560 264 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
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