RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35F4	A4IF30	521 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PLPP3	O14495	311 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINA1	P01009	418 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CD40	P25942	277 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CDKN1A	P38936	164 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PTH2R	P49190	550 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	BID	P55957	195 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ATP5J2	P56134	94 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SELENOW	P63302	87 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF74	Q16587	644 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SHE	Q5VZ18	495 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	RNF148	Q8N7C7	305 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	WDR31	Q8NA23	367 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PFN4	Q8NHR9	129 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TXNDC15	Q96J42	360 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	OR2M2	Q96R28	347 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	GPR35	Q9HC97	309 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	RHCG	Q9UBD6	479 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SHISA9	B4DS77	424 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFAB1	O14561	156 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	OR5F1	O95221	314 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	LYPD3	O95274	346 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	IFNW1	P05000	195 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	IFNGR1	P15260	489 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MELK	Q14680	651 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM239	Q8WW34	195 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SGTB	Q96EQ0	304 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880		Q96MF0	132 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	FKRP	Q9H9S5	495 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MED31	Q9Y3C7	131 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SOD3	P08294	240 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	PRDX6	P30041	224 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CSNK1A1	P48729	337 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	FABP6	P51161	128 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	UGT2B15	P54855	530 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	NPRL3	Q12980	569 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	IFI44L	Q53G44	452 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	PXK	Q7Z7A4	578 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM123	Q8N131	208 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	PRRC1	Q96M27	445 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	MOK	Q9UQ07	419 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880		V9GYQ6	96 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	DYNC1I1	O14576	645 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	PIP5K1C	O60331	668 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	DCTN3	O75935	186 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF432	O94892	652 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	MT-ND1	P03886	318 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CD79A	P11912	226 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	FUT1	P19526	365 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ST3GAL3	Q11203	375 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	AGAP6	Q5VW22	663 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	VHLL	Q6RSH7	139 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34

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