RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468150.1

CAMSAP1-205, Transcript of calmodulin regulated spectrin associated protein 1, human

TSL 5

Gene CAMSAP1, Length 284 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CAMSAP1-205	ENST00000468150	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CAMSAP1-205	ENST00000468150	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CAMSAP1-205	ENST00000468150	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CAMSAP1-205	ENST00000468150	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CAMSAP1-205	ENST00000468150	POLE	Q07864	2286 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CAMSAP1-205	ENST00000468150	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CAMSAP1-205	ENST00000468150	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	FRG2C	A6NGY1	282 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	UPK1A	O00322	258 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	HS6ST1	O60243	411 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SLC25A12	O75746	678 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	KRT34	O76011	436 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	IL6	P05231	212 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ACP2	P11117	423 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SFTPC	P11686	197 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	HPGD	P15428	266 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CAPN3	P20807	821 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CPOX	P36551	454 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CRAT	P43155	626 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	DNASE1L1	P49184	302 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	KHK	P50053	298 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CCR4	P51679	360 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	MLLT10	P55197	1068 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	MLF1	P58340	268 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	KCNJ2	P63252	427 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	FUT7	Q11130	342 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	KLRB1	Q12918	225 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PDE7A	Q13946	482 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	DECR1	Q16698	335 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	OPN5	Q6U736	354 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SLC34A3	Q8N130	599 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	NUBPL	Q8TB37	319 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SFXN5	Q8TD22	340 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PSMF1	Q92530	271 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	RAB8B	Q92930	207 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TMBIM1	Q969X1	311 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TESC	Q96BS2	214 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ITCH	Q96J02	903 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	OR7D2	Q96RA2	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	NPAS2	Q99743	824 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	MMP28	Q9H239	520 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	OR51I1	Q9H343	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150		A0A0G2JMM0	328 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150		A0A1W2PPB8	328 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150		A0A1W2PQ72	361 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150		A0A1W2PRS3	328 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TP53I11	O14683	189 aa		4.14	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms